150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0491 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  49.94 
 
 		 1147 aa  766    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  52 
 
 		 1120 aa  822    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  100 
 
 		 1178 aa  2367    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  62.19 
 
 		 1177 aa  1100    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  39.43 
 
 		 1170 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  38.07 
 
 		 1159 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  32.51 
 
 		 1089 aa  276  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  28.3 
 
 		 1076 aa  235  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  28.16 
 
 		 1132 aa  228  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1154 aa  218  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1209 aa  215  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1039 aa  194  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1104 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1338 aa  174  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1210 aa  161  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1184 aa  146  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1298 aa  142  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1426 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  26.19 
 
 		 1256 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  21.83 
 
 		 882 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.62 
 
 		 1194 aa  113  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1299 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1036 aa  105  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.6 
 
 		 995 aa  104  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  29.19 
 
 		 1058 aa  98.2  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.66 
 
 		 1041 aa  96.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  28.16 
 
 		 950 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  25.34 
 
 		 792 aa  95.9  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.87 
 
 		 1252 aa  94.7  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  26.4 
 
 		 1257 aa  93.6  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.63 
 
 		 1244 aa  92.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  25.7 
 
 		 1186 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.4 
 
 		 838 aa  85.1  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  27.78 
 
 		 1020 aa  84  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  44.44 
 
 		 410 aa  84.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1241 aa  83.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.2 
 
 		 836 aa  82.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1338 aa  79.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1125 aa  79.7  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.49 
 
 		 416 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1088 aa  75.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1162 aa  76.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.52 
 
 		 974 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  35.45 
 
 		 1343 aa  70.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  31.25 
 
 		 1306 aa  68.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  27.17 
 
 		 1336 aa  68.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  30.81 
 
 		 1318 aa  68.6  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  22.56 
 
 		 1183 aa  68.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  23.57 
 
 		 1167 aa  68.2  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1333 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  29.61 
 
 		 1338 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  26.8 
 
 		 1055 aa  66.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  26.88 
 
 		 816 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  29.71 
 
 		 1358 aa  65.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25 
 
 		 795 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1612 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  31.54 
 
 		 1354 aa  63.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1171 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  30.17 
 
 		 1331 aa  63.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  26.96 
 
 		 1355 aa  63.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1218 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  32.5 
 
 		 1432 aa  62  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.29 
 
 		 1322 aa  62  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1422 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1250 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1195 aa  61.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  22.42 
 
 		 1219 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  21.53 
 
 		 612 aa  60.1  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1373 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1243 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  33.05 
 
 		 1219 aa  59.7  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  32.79 
 
 		 652 aa  59.7  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  20.26 
 
 		 1182 aa  59.3  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  21.82 
 
 		 1160 aa  59.3  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1270 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1461 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  23.7 
 
 		 1205 aa  58.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1339 aa  58.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1497 aa  58.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1347 aa  57.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1452 aa  57.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.87 
 
 		 1319 aa  57.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  22.12 
 
 		 846 aa  57  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1484 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.82 
 
 		 595 aa  57.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  32.74 
 
 		 1712 aa  57  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1324 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1347 aa  56.2  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1441 aa  56.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.83 
 
 		 694 aa  55.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  25.86 
 
 		 404 aa  55.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  28.28 
 
 		 1144 aa  55.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  34.71 
 
 		 1365 aa  55.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  23.5 
 
 		 1321 aa  55.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1751 aa  55.5  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  23.6 
 
 		 706 aa  55.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1093 aa  55.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1332 aa  54.3  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>