143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2397 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1608    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  57.16 
 
 		 816 aa  828    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  49.6 
 
 		 882 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1476  hypothetical protein  43.25 
 
 		 247 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000317669  normal  0.706918 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1088 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  31.99 
 
 		 838 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  26.88 
 
 		 1089 aa  137  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  37.3 
 
 		 950 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 		 1041 aa  105  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.92 
 
 		 995 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1036 aa  96.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1120 aa  96.3  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.86 
 
 		 836 aa  95.9  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.39 
 
 		 1058 aa  95.5  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1178 aa  95.5  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.85 
 
 		 974 aa  92.8  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  32.08 
 
 		 416 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1177 aa  89  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1147 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.48 
 
 		 1020 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  28.12 
 
 		 652 aa  72  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  31.47 
 
 		 1170 aa  70.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1104 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  40.74 
 
 		 1336 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1195 aa  66.6  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1426 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  38.53 
 
 		 1343 aa  64.7  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  41.44 
 
 		 1243 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  25.89 
 
 		 746 aa  64.3  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  36.19 
 
 		 1432 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1125 aa  62  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1422 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  36.7 
 
 		 1338 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  34.09 
 
 		 1159 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1282 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1338 aa  61.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  36.7 
 
 		 1355 aa  61.2  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1290 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  35.9 
 
 		 1322 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1282 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  35.71 
 
 		 1358 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  37.96 
 
 		 1354 aa  59.3  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  35.71 
 
 		 1055 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1339 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  35.46 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  25.81 
 
 		 911 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1210 aa  58.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  37.61 
 
 		 1318 aa  58.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1339 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1339 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  38.74 
 
 		 1373 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1366 aa  57.4  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 908 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  28.15 
 
 		 795 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  27.02 
 
 		 1167 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.4 
 
 		 1194 aa  56.2  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1347 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1333 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  39.45 
 
 		 1306 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  35.85 
 
 		 1319 aa  55.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1441 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  28.38 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  26.62 
 
 		 684 aa  54.7  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  23.11 
 
 		 1180 aa  54.3  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  23.95 
 
 		 909 aa  54.3  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.24 
 
 		 573 aa  54.3  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  32.09 
 
 		 1331 aa  54.3  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  31 
 
 		 1347 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1324 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1209 aa  53.9  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.49 
 
 		 1076 aa  53.9  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  27.8 
 
 		 1239 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  35.78 
 
 		 1321 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1298 aa  52.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1459 aa  52  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  24.1 
 
 		 1712 aa  51.6  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  33.81 
 
 		 846 aa  51.6  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1461 aa  51.2  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.35 
 
 		 562 aa  51.2  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.62 
 
 		 1277 aa  50.8  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1231 aa  50.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1440 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.88 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.83 
 
 		 1278 aa  50.4  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  21.94 
 
 		 570 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  31.09 
 
 		 478 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  26.17 
 
 		 493 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1365 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1581 aa  50.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1425 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.17 
 
 		 1256 aa  50.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1321 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  34.65 
 
 		 914 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  58.06 
 
 		 1363 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1359 aa  49.3  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  21.74 
 
 		 554 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  43.1 
 
 		 1322 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  34.91 
 
 		 926 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  20.32 
 
 		 553 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.19 
 
 		 1134 aa  48.5  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>