84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1895 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  55.03 
 
 		 1183 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  100 
 
 		 612 aa  1276    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  52.49 
 
 		 1171 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  49.72 
 
 		 1182 aa  535  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  46.24 
 
 		 1162 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  44.22 
 
 		 1174 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  41.13 
 
 		 1167 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  40.94 
 
 		 1160 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  40.2 
 
 		 1180 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  37.62 
 
 		 1205 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  40.16 
 
 		 1144 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  38.74 
 
 		 1140 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  37.48 
 
 		 1131 aa  333  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  48.04 
 
 		 1218 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  30.32 
 
 		 1219 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1430 aa  166  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1125 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1241 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1324 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1162 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1141 aa  147  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  26.91 
 
 		 731 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1270 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1154 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1174 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1154 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1129 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1359 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1425 aa  97.8  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1497 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  28.97 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1484 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  27.83 
 
 		 300 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.43 
 
 		 995 aa  72.8  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.88 
 
 		 950 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  21.01 
 
 		 1036 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  27.44 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  20.52 
 
 		 1058 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  24.28 
 
 		 1239 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1282 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  31.87 
 
 		 882 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1178 aa  59.7  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1177 aa  57.4  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.41 
 
 		 836 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.97 
 
 		 1132 aa  56.2  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1120 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  28.77 
 
 		 416 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.58 
 
 		 974 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1195 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.98 
 
 		 1020 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.46 
 
 		 1170 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  31.71 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  30.95 
 
 		 1252 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  37.18 
 
 		 929 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  27.49 
 
 		 1089 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1342 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1243 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  28.04 
 
 		 1244 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  20.23 
 
 		 746 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1339 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  28.26 
 
 		 1076 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  30.3 
 
 		 1355 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  36.47 
 
 		 909 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  28.04 
 
 		 1257 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1209 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1147 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  29.21 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1154 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1039 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  36.14 
 
 		 1358 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1422 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1321 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  26.44 
 
 		 652 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  29.49 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  28.68 
 
 		 1159 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.52 
 
 		 1322 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.99 
 
 		 918 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  25.2 
 
 		 518 aa  43.9  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1173 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.07 
 
 		 1002 aa  43.9  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.81 
 
 		 1343 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>