95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1156 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  100 
 
 
1324 aa  2679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  51 
 
 
1497 aa  1248    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  49.78 
 
 
1484 aa  1232    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  51.29 
 
 
1425 aa  1308    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.96 
 
 
1270 aa  296  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  26.76 
 
 
1140 aa  283  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  27.98 
 
 
1359 aa  277  9e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25.11 
 
 
1182 aa  265  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  25.25 
 
 
1160 aa  264  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  26.09 
 
 
1180 aa  261  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  28.71 
 
 
1162 aa  233  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  26.96 
 
 
1183 aa  232  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.67 
 
 
1241 aa  229  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  28.01 
 
 
1171 aa  227  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.04 
 
 
1205 aa  227  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  27.32 
 
 
1131 aa  211  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  27.27 
 
 
1326 aa  199  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  26 
 
 
1167 aa  191  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  25 
 
 
1218 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.88 
 
 
1430 aa  161  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  24.1 
 
 
1144 aa  154  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  28.13 
 
 
612 aa  152  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.51 
 
 
1125 aa  148  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.98 
 
 
1141 aa  145  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.84 
 
 
1129 aa  142  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  27.89 
 
 
1174 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  26.27 
 
 
1154 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  28.63 
 
 
1154 aa  132  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  25.34 
 
 
1219 aa  131  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  24.9 
 
 
1162 aa  124  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  27.65 
 
 
731 aa  118  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  25.47 
 
 
706 aa  114  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  27.97 
 
 
309 aa  94.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  32.37 
 
 
1107 aa  90.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  29.61 
 
 
1174 aa  82.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.58 
 
 
1177 aa  76.3  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  30.89 
 
 
950 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  33.93 
 
 
288 aa  62.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.56 
 
 
995 aa  62  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  24.62 
 
 
1154 aa  62  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.66 
 
 
838 aa  62  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  31.03 
 
 
1058 aa  62  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.53 
 
 
1076 aa  60.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  20.85 
 
 
1209 aa  60.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  29.3 
 
 
332 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  20.22 
 
 
882 aa  58.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  39.24 
 
 
974 aa  58.5  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  27.78 
 
 
300 aa  58.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  21.25 
 
 
1178 aa  57  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.62 
 
 
1036 aa  55.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  32.09 
 
 
1318 aa  55.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  42.86 
 
 
416 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  35.16 
 
 
792 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  33.04 
 
 
795 aa  54.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  40 
 
 
1195 aa  53.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  27.03 
 
 
1120 aa  52.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.22 
 
 
1159 aa  52  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  36.25 
 
 
1222 aa  51.6  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  39.36 
 
 
1339 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  26.79 
 
 
1339 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  26.79 
 
 
1339 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  31.9 
 
 
1189 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  32.38 
 
 
1002 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  21.74 
 
 
1088 aa  50.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.17 
 
 
1338 aa  50.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  30.1 
 
 
1298 aa  50.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.46 
 
 
1132 aa  50.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  36.62 
 
 
1239 aa  50.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.77 
 
 
836 aa  49.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  36.25 
 
 
909 aa  49.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  20 
 
 
1104 aa  49.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  35.29 
 
 
1282 aa  48.9  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  19.75 
 
 
494 aa  48.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  32.89 
 
 
1422 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  34.48 
 
 
1432 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  37.5 
 
 
1319 aa  48.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  37.68 
 
 
746 aa  48.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  32.35 
 
 
1338 aa  47.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30.49 
 
 
1041 aa  47.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  23.68 
 
 
1256 aa  46.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.89 
 
 
1581 aa  46.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 
570 aa  46.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.54 
 
 
1461 aa  46.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  26.76 
 
 
1093 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.9 
 
 
882 aa  46.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.41 
 
 
1219 aa  45.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  32.32 
 
 
1233 aa  45.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  31.73 
 
 
1170 aa  45.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  32.18 
 
 
578 aa  45.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  27.27 
 
 
1306 aa  45.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  37.33 
 
 
908 aa  45.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 
584 aa  45.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  32.18 
 
 
578 aa  45.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  30.43 
 
 
1322 aa  45.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.23 
 
 
929 aa  45.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>