138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1534 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  48.43 
 
 		 1147 aa  1059    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  100 
 
 		 1120 aa  2273    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  52 
 
 		 1178 aa  823    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  50.25 
 
 		 1177 aa  1067    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  35.21 
 
 		 1170 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  31.73 
 
 		 1132 aa  508  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1209 aa  498  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  29.8 
 
 		 1076 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1154 aa  347  7e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  42.29 
 
 		 1159 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  31.72 
 
 		 995 aa  316  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1338 aa  300  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  39.29 
 
 		 1244 aa  297  8e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  38.37 
 
 		 1257 aa  291  6e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  30.26 
 
 		 1089 aa  259  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1426 aa  253  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1036 aa  210  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.43 
 
 		 974 aa  197  8.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1299 aa  180  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1184 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1039 aa  160  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1210 aa  154  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1104 aa  135  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  21.68 
 
 		 882 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  27.95 
 
 		 1256 aa  122  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.16 
 
 		 1058 aa  120  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1298 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  27.24 
 
 		 1252 aa  119  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  33.02 
 
 		 247 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.09 
 
 		 950 aa  116  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1612 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.77 
 
 		 1432 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.96 
 
 		 1194 aa  104  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1088 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  28.03 
 
 		 416 aa  98.6  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  28.76 
 
 		 792 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.91 
 
 		 1041 aa  95.9  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.06 
 
 		 1020 aa  93.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.7 
 
 		 410 aa  94  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  24.19 
 
 		 404 aa  86.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  21.52 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.6 
 
 		 838 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.87 
 
 		 836 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  22.27 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  25.33 
 
 		 1167 aa  82  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1125 aa  79.7  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  23.82 
 
 		 1186 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.46 
 
 		 629 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1241 aa  73.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.89 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  30.08 
 
 		 694 aa  72  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  21.95 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  25.7 
 
 		 1180 aa  72  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  30.23 
 
 		 1336 aa  68.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1243 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  35.34 
 
 		 1343 aa  67.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  20.58 
 
 		 1239 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  25.88 
 
 		 816 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  27.75 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1270 aa  65.1  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1338 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1332 aa  63.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1422 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1171 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1195 aa  63.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1333 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  24.94 
 
 		 1144 aa  62.4  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  21.83 
 
 		 1205 aa  62  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  22.56 
 
 		 1189 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  26.5 
 
 		 1183 aa  60.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  23.69 
 
 		 1160 aa  59.7  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1162 aa  60.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1182 aa  58.5  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1365 aa  58.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.07 
 
 		 1319 aa  58.2  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  38.82 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1209 aa  58.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1373 aa  58.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1497 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.66 
 
 		 1712 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  23.67 
 
 		 523 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  29.73 
 
 		 1318 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1231 aa  56.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  33.62 
 
 		 1354 aa  56.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  37.5 
 
 		 504 aa  55.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  22.08 
 
 		 612 aa  55.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1282 aa  55.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1347 aa  55.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  30.57 
 
 		 1338 aa  55.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1366 aa  54.3  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  24.62 
 
 		 684 aa  54.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  36.14 
 
 		 466 aa  53.5  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1321 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1359 aa  53.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1290 aa  53.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  30.58 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1339 aa  52.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1339 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1339 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1324 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>