127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3080 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  100 
 
 		 1425 aa  2923    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  57.56 
 
 		 1497 aa  1585    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  54.88 
 
 		 1484 aa  1474    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  51.57 
 
 		 1324 aa  1317    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1270 aa  280  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1359 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  23.71 
 
 		 1160 aa  244  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  24.11 
 
 		 1180 aa  239  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  23.54 
 
 		 1144 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1241 aa  227  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1140 aa  220  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  24.03 
 
 		 1167 aa  219  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1171 aa  213  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1131 aa  206  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  23.22 
 
 		 1205 aa  184  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1430 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  25 
 
 		 1326 aa  181  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1162 aa  179  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  25.75 
 
 		 1183 aa  169  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1141 aa  158  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1129 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1162 aa  146  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1125 aa  144  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1174 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1182 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  23.65 
 
 		 1219 aa  135  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1154 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1154 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1174 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  27.78 
 
 		 731 aa  109  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  105  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  24.35 
 
 		 706 aa  99.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1218 aa  100  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  27.14 
 
 		 612 aa  97.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1107 aa  83.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1177 aa  81.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  27.74 
 
 		 288 aa  75.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  26.15 
 
 		 300 aa  67.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  20.38 
 
 		 882 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  21.92 
 
 		 1277 aa  67  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1426 aa  61.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  33.06 
 
 		 950 aa  60.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.39 
 
 		 694 aa  60.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.95 
 
 		 1278 aa  59.7  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1461 aa  58.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  34.74 
 
 		 1318 aa  57.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  35.29 
 
 		 416 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  41.18 
 
 		 795 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.37 
 
 		 1076 aa  57  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  34.31 
 
 		 1319 aa  56.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1339 aa  56.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1612 aa  56.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.16 
 
 		 882 aa  56.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  35.8 
 
 		 1432 aa  56.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  42.31 
 
 		 974 aa  55.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  29.91 
 
 		 1058 aa  55.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1347 aa  55.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1581 aa  55.5  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  22.22 
 
 		 1089 aa  55.5  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1088 aa  54.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  21.88 
 
 		 1186 aa  54.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1104 aa  53.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.22 
 
 		 1041 aa  54.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.78 
 
 		 1159 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1282 aa  54.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.22 
 
 		 1256 aa  53.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  34.07 
 
 		 1343 aa  54.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  20.13 
 
 		 1209 aa  53.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1154 aa  52.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  23.96 
 
 		 570 aa  52.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  31.9 
 
 		 1170 aa  52.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  27.1 
 
 		 1244 aa  52.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  27.1 
 
 		 1252 aa  52.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  27.1 
 
 		 1257 aa  52.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.58 
 
 		 838 aa  52  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1338 aa  52  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.86 
 
 		 1194 aa  51.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.55 
 
 		 995 aa  51.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1120 aa  51.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.36 
 
 		 1002 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  34.91 
 
 		 1239 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.77 
 
 		 1306 aa  50.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  27.27 
 
 		 1338 aa  50.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1441 aa  50.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1452 aa  50.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1093 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 909 aa  49.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1147 aa  49.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  28.47 
 
 		 792 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  29.87 
 
 		 1581 aa  49.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1751 aa  49.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  29.52 
 
 		 595 aa  49.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1178 aa  49.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.13 
 
 		 1354 aa  48.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  31.86 
 
 		 1321 aa  48.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  23.39 
 
 		 934 aa  48.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1422 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1210 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  31.63 
 
 		 746 aa  47.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1557 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>