157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1882 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  36.43 
 
 
1321 aa  757    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  43.89 
 
 
1336 aa  1010    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  37.47 
 
 
1319 aa  785    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  36.88 
 
 
1343 aa  723    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  37.77 
 
 
1338 aa  820    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  39.86 
 
 
1318 aa  853    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  47.61 
 
 
1712 aa  930    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  39.37 
 
 
1306 aa  830    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  39.69 
 
 
1354 aa  882    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  36.22 
 
 
1459 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  37.77 
 
 
1331 aa  700    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  51.54 
 
 
1339 aa  1268    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  38.41 
 
 
1322 aa  764    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  45.55 
 
 
1373 aa  995    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  100 
 
 
1422 aa  2871    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  56.7 
 
 
1243 aa  774    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  36.37 
 
 
1358 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  43.27 
 
 
1333 aa  1026    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  36.12 
 
 
1322 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  40.06 
 
 
1355 aa  940    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  36.79 
 
 
1219 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  43.67 
 
 
1338 aa  925    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  38.83 
 
 
1055 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  40.51 
 
 
1282 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  40.02 
 
 
1290 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  29.39 
 
 
1442 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  21.59 
 
 
1250 aa  236  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.32 
 
 
1250 aa  228  9e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  19.6 
 
 
1277 aa  213  2e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.3 
 
 
1278 aa  209  3e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  29.3 
 
 
1432 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25.3 
 
 
1098 aa  162  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  25.11 
 
 
1612 aa  160  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  38.48 
 
 
926 aa  150  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  31.59 
 
 
1441 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.37 
 
 
1363 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  24.78 
 
 
826 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  25.98 
 
 
1572 aa  142  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.27 
 
 
1426 aa  139  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  29.98 
 
 
1461 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  32.15 
 
 
1709 aa  136  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.35 
 
 
1440 aa  133  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.29 
 
 
1573 aa  132  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  27.06 
 
 
1452 aa  130  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  31.37 
 
 
1321 aa  128  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.16 
 
 
1581 aa  127  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.87 
 
 
1332 aa  126  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.1 
 
 
1346 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  26.6 
 
 
1349 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  30.28 
 
 
1353 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  39.81 
 
 
1347 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  31.43 
 
 
1339 aa  118  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  31.43 
 
 
1339 aa  118  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.06 
 
 
1375 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  28.97 
 
 
1022 aa  116  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  33.64 
 
 
1409 aa  115  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  39.78 
 
 
846 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  30.59 
 
 
1342 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  27.19 
 
 
1575 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  40.33 
 
 
1365 aa  108  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  27.85 
 
 
1579 aa  108  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.72 
 
 
1298 aa  108  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.11 
 
 
1546 aa  107  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  29.16 
 
 
1366 aa  104  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.76 
 
 
1640 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  27.8 
 
 
1581 aa  95.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  35.53 
 
 
1347 aa  94  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  23.11 
 
 
1642 aa  93.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  23.11 
 
 
1640 aa  93.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  23.11 
 
 
1644 aa  90.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25.9 
 
 
1557 aa  88.6  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.67 
 
 
795 aa  87.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.45 
 
 
974 aa  84.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.96 
 
 
1210 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  24.57 
 
 
1751 aa  81.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  32.12 
 
 
1041 aa  80.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.06 
 
 
995 aa  79.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.86 
 
 
1159 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  20.4 
 
 
1256 aa  74.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.12 
 
 
1058 aa  73.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  21.4 
 
 
1089 aa  73.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  30.8 
 
 
1154 aa  73.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.57 
 
 
1076 aa  72.8  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25 
 
 
1036 aa  72.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  26.2 
 
 
919 aa  71.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  33.33 
 
 
950 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.83 
 
 
1177 aa  67.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.94 
 
 
1257 aa  66.6  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.41 
 
 
1209 aa  66.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.77 
 
 
1252 aa  65.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20.94 
 
 
1244 aa  65.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  27.69 
 
 
1132 aa  64.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  27.05 
 
 
1120 aa  63.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  26.61 
 
 
1039 aa  62.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  36.36 
 
 
1147 aa  62.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  24.56 
 
 
1178 aa  62  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  29.6 
 
 
1189 aa  61.6  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  34.93 
 
 
652 aa  62  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  30.33 
 
 
1338 aa  61.6  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  39.64 
 
 
792 aa  61.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>