106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1299 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  36.9 
 
 		 1180 aa  732    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  39.93 
 
 		 1183 aa  791    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  41.4 
 
 		 1160 aa  865    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1162 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  34.81 
 
 		 1205 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  35.47 
 
 		 1171 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  35.81 
 
 		 1167 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  100 
 
 		 1144 aa  2361    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1140 aa  650    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1182 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  34.98 
 
 		 1174 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1131 aa  602  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  30.18 
 
 		 1219 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  39.67 
 
 		 612 aa  399  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  40.46 
 
 		 1218 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1270 aa  347  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1125 aa  285  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1241 aa  249  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1324 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1425 aa  234  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1359 aa  213  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1430 aa  205  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1484 aa  183  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  35.03 
 
 		 332 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1141 aa  159  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1162 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1497 aa  138  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1154 aa  132  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  25.35 
 
 		 731 aa  131  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1174 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1129 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1154 aa  128  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  33.92 
 
 		 309 aa  119  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  24.87 
 
 		 706 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1326 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1107 aa  106  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  20.79 
 
 		 950 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.51 
 
 		 882 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.78 
 
 		 1058 aa  73.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  41.18 
 
 		 106 aa  72.4  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  28.21 
 
 		 300 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  26.69 
 
 		 288 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  31.15 
 
 		 974 aa  70.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1177 aa  64.3  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1036 aa  63.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1120 aa  62.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1178 aa  62.4  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  20.38 
 
 		 1020 aa  59.7  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  44.93 
 
 		 416 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.84 
 
 		 995 aa  55.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1365 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  32.59 
 
 		 1089 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  38.16 
 
 		 1239 aa  52.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  21.72 
 
 		 1170 aa  52.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1282 aa  52.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  36 
 
 		 1195 aa  52  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  26.55 
 
 		 528 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  30 
 
 		 1209 aa  51.6  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  26.5 
 
 		 1076 aa  51.6  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1426 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.98 
 
 		 1134 aa  51.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1339 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 537 aa  49.7  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  23.66 
 
 		 404 aa  50.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.55 
 
 		 1319 aa  49.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  37.5 
 
 		 1189 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.06 
 
 		 1338 aa  48.9  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  24.82 
 
 		 1432 aa  48.9  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  21.74 
 
 		 1256 aa  48.9  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  27.91 
 
 		 519 aa  48.5  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.05 
 
 		 694 aa  48.5  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  29.09 
 
 		 521 aa  48.5  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1347 aa  48.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1338 aa  48.1  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  23.65 
 
 		 540 aa  47.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  28.07 
 
 		 526 aa  48.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1039 aa  47.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  21.77 
 
 		 792 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.15 
 
 		 1041 aa  48.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  29.09 
 
 		 524 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  31.11 
 
 		 481 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  25.52 
 
 		 584 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  29.09 
 
 		 522 aa  47.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.02 
 
 		 1358 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  34.57 
 
 		 1002 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1441 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  24.77 
 
 		 547 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1612 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1373 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1243 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.18 
 
 		 929 aa  46.2  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  24.29 
 
 		 1322 aa  46.2  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  27.69 
 
 		 1055 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.86 
 
 		 836 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.5 
 
 		 462 aa  46.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  36.49 
 
 		 871 aa  46.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1231 aa  45.8  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  34.21 
 
 		 1318 aa  45.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1147 aa  45.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1298 aa  45.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>