52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1124 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 1326 aa  2721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1359 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1270 aa  265  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1324 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1241 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1430 aa  194  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  25.43 
 
 		 1167 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1425 aa  189  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  25.36 
 
 		 1180 aa  171  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1182 aa  169  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  26.21 
 
 		 1160 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  26.66 
 
 		 1484 aa  158  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1140 aa  150  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1497 aa  150  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.06 
 
 		 1205 aa  147  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1131 aa  137  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1174 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  24.6 
 
 		 612 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  22.45 
 
 		 1219 aa  129  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  22.63 
 
 		 1144 aa  122  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  24.48 
 
 		 1183 aa  104  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1171 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1125 aa  97.8  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1154 aa  90.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  25.28 
 
 		 288 aa  89.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  26.33 
 
 		 706 aa  84.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  27.6 
 
 		 882 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  26.89 
 
 		 300 aa  80.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  27.11 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1154 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1162 aa  72.4  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1141 aa  70.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1129 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1174 aa  61.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1218 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1107 aa  56.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.1 
 
 		 1058 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  28.71 
 
 		 950 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  27.75 
 
 		 731 aa  55.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.06 
 
 		 974 aa  53.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  29.1 
 
 		 775 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  22.18 
 
 		 846 aa  49.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  26.97 
 
 		 834 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  27.05 
 
 		 1277 aa  49.3  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  28.28 
 
 		 1318 aa  48.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  26.23 
 
 		 1278 aa  48.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  26.26 
 
 		 1252 aa  46.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.7 
 
 		 1244 aa  46.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  24.72 
 
 		 1257 aa  46.2  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1612 aa  45.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25 
 
 		 1298 aa  45.1  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>