148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0068 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  81.57 
 
 
1257 aa  1954    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  54.35 
 
 
1256 aa  1187    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  100 
 
 
1244 aa  2482    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  36.03 
 
 
1299 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  75.47 
 
 
1252 aa  1743    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  41.62 
 
 
1186 aa  545  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.33 
 
 
1194 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  33.13 
 
 
1209 aa  395  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  39.57 
 
 
1177 aa  306  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  29.27 
 
 
1132 aa  287  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  39.29 
 
 
1120 aa  283  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  29.11 
 
 
1154 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  35.83 
 
 
1159 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  29.05 
 
 
1076 aa  265  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32.99 
 
 
995 aa  228  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  34.12 
 
 
1147 aa  225  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  32.48 
 
 
1036 aa  214  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  35.03 
 
 
1426 aa  208  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.11 
 
 
974 aa  190  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  29.42 
 
 
1338 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.75 
 
 
1432 aa  145  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  26.93 
 
 
1089 aa  137  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.13 
 
 
1058 aa  135  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  29.18 
 
 
410 aa  131  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.06 
 
 
1612 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.04 
 
 
1104 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  21.65 
 
 
1184 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.96 
 
 
1298 aa  107  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.37 
 
 
1210 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  27.51 
 
 
404 aa  99.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  33.18 
 
 
247 aa  99.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  33.99 
 
 
416 aa  93.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.12 
 
 
1452 aa  92.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.22 
 
 
1461 aa  92.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  25.98 
 
 
1170 aa  92.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  29.56 
 
 
1088 aa  92  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.63 
 
 
1178 aa  92  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  24.22 
 
 
1712 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.87 
 
 
838 aa  86.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  23.13 
 
 
1333 aa  85.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.97 
 
 
1020 aa  83.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30.51 
 
 
1041 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.02 
 
 
1290 aa  82.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.08 
 
 
518 aa  82.4  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.6 
 
 
1282 aa  82.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.33 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  21.13 
 
 
882 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.96 
 
 
1277 aa  79.3  0.0000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.06 
 
 
1039 aa  79.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.65 
 
 
1321 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  22.86 
 
 
1338 aa  77.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  23.23 
 
 
1409 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  22.05 
 
 
1343 aa  76.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.69 
 
 
950 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  21.75 
 
 
1342 aa  76.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  23.73 
 
 
1354 aa  75.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  27.2 
 
 
1250 aa  75.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  22.43 
 
 
1441 aa  75.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  27.2 
 
 
1250 aa  74.3  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  22.16 
 
 
1336 aa  74.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  20.71 
 
 
1347 aa  73.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  24.62 
 
 
1278 aa  73.6  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  17.75 
 
 
1243 aa  73.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  34.56 
 
 
694 aa  73.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  22.69 
 
 
1022 aa  72  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.59 
 
 
1373 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22.69 
 
 
1375 aa  70.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  22.34 
 
 
1219 aa  68.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.29 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.64 
 
 
1322 aa  68.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  21.86 
 
 
1338 aa  67.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  25.23 
 
 
522 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  19.48 
 
 
1339 aa  68.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  24.14 
 
 
527 aa  67.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.39 
 
 
1573 aa  66.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  31.11 
 
 
652 aa  66.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  20.77 
 
 
1339 aa  66.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  20.77 
 
 
1339 aa  66.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.79 
 
 
1353 aa  65.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.35 
 
 
1459 aa  65.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  26.37 
 
 
1642 aa  65.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  20.75 
 
 
1331 aa  65.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  20.94 
 
 
1422 aa  65.1  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  26.87 
 
 
1640 aa  65.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  26.37 
 
 
1644 aa  65.1  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  22.41 
 
 
1365 aa  65.1  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  26.13 
 
 
846 aa  65.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.58 
 
 
1306 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.87 
 
 
1640 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.87 
 
 
629 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.19 
 
 
836 aa  62  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 
493 aa  61.6  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  26.63 
 
 
1355 aa  61.6  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  20.31 
 
 
1319 aa  61.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  21.39 
 
 
1366 aa  61.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  22.55 
 
 
1321 aa  60.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  24.52 
 
 
570 aa  59.3  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.13 
 
 
1358 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  33.06 
 
 
595 aa  57.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  25.81 
 
 
1751 aa  57.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>