145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0588 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  100 
 
 		 527 aa  1084    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.41 
 
 		 389 aa  93.6  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  23.21 
 
 		 423 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1036 aa  84.7  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  29.36 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  27.78 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.54 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  27.4 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1154 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.29 
 
 		 995 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.19 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  22.3 
 
 		 489 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  29.23 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.18 
 
 		 1020 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  28.74 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.01 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  29.59 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  22.25 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  24.14 
 
 		 1244 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.71 
 
 		 1132 aa  66.6  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1426 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1147 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  23.34 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.16 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  32.38 
 
 		 652 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 1693 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  26.44 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  24.01 
 
 		 1257 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  26.49 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1338 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.92 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1299 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  22.92 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  26 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.81 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24.56 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.22 
 
 		 1159 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  26.03 
 
 		 1256 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  20.27 
 
 		 522 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  24.37 
 
 		 691 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  23.18 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  28.04 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.52 
 
 		 1058 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  26.26 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  21.71 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.52 
 
 		 1170 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  29.06 
 
 		 1252 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 		 730 aa  54.3  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1612 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.38 
 
 		 416 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  25.7 
 
 		 481 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  25.1 
 
 		 489 aa  53.9  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  21.97 
 
 		 527 aa  53.9  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  23.83 
 
 		 534 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  28.49 
 
 		 1932 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  23.56 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  26.71 
 
 		 1417 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  30.68 
 
 		 449 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  22.89 
 
 		 573 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 450 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  26.85 
 
 		 189 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  22.22 
 
 		 522 aa  50.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 670 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  32.5 
 
 		 1925 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  24.31 
 
 		 489 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  28.1 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  28 
 
 		 1516 aa  50.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  21.4 
 
 		 677 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  22.65 
 
 		 489 aa  50.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  25 
 
 		 1934 aa  50.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  28.28 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  29.5 
 
 		 1575 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  24.37 
 
 		 775 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  24.35 
 
 		 526 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1104 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 658 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.23 
 
 		 557 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  34.38 
 
 		 660 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  21.01 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  21.9 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  26 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  25.56 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 834 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  25.87 
 
 		 187 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 506 aa  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  21.36 
 
 		 515 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  19.41 
 
 		 499 aa  47.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  21.52 
 
 		 506 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1125 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  23.39 
 
 		 1414 aa  47  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  25.17 
 
 		 187 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1484 aa  47  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  20.18 
 
 		 708 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  28.69 
 
 		 1703 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>