66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1902 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  807    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  38.64 
 
 
410 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.59 
 
 
950 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.04 
 
 
995 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.14 
 
 
1194 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  26.51 
 
 
1257 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.86 
 
 
1177 aa  103  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.11 
 
 
1036 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  26.11 
 
 
1170 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  27.51 
 
 
1244 aa  99.4  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  36.97 
 
 
1058 aa  93.2  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.11 
 
 
1209 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  24.09 
 
 
673 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  24.19 
 
 
1120 aa  86.7  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  20.49 
 
 
926 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  25.55 
 
 
1076 aa  80.1  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.2 
 
 
1154 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  29.26 
 
 
1186 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.2 
 
 
974 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  28.28 
 
 
1104 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  26.29 
 
 
1132 aa  69.7  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.53 
 
 
1039 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.21 
 
 
1147 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.57 
 
 
1020 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  33.74 
 
 
1252 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1166  hypothetical protein  46.55 
 
 
60 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.02 
 
 
1432 aa  60.1  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.17 
 
 
836 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  27.56 
 
 
1159 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.97 
 
 
1125 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.9 
 
 
1612 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.86 
 
 
1178 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  22.91 
 
 
553 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.38 
 
 
1426 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  28.38 
 
 
494 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  21.2 
 
 
1180 aa  53.9  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  25.21 
 
 
1183 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  31.53 
 
 
684 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  20.96 
 
 
1299 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  22.22 
 
 
1160 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  23.66 
 
 
1144 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.14 
 
 
562 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  33.33 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 
694 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  33.05 
 
 
1256 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  31.25 
 
 
1338 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  25.55 
 
 
494 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  21.31 
 
 
518 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  28.33 
 
 
629 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  26.13 
 
 
652 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.17 
 
 
493 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  20.44 
 
 
1205 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  22.37 
 
 
524 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  31.96 
 
 
578 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  35.44 
 
 
478 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  20.88 
 
 
908 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  31.96 
 
 
578 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.4 
 
 
557 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  22.75 
 
 
1218 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  27.12 
 
 
1182 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  25 
 
 
731 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  19.81 
 
 
1171 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  27.5 
 
 
1285 aa  43.9  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  23.28 
 
 
1430 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  22.63 
 
 
1184 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  32.67 
 
 
466 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>