94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1713 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 478 aa  987    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  41.52 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  27.06 
 
 		 518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25.9 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  25.79 
 
 		 562 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.96 
 
 		 493 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.06 
 
 		 629 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  26.01 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1426 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1209 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1154 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  24.25 
 
 		 1432 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.15 
 
 		 995 aa  73.6  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  38.05 
 
 		 974 aa  73.6  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.68 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.17 
 
 		 1612 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.98 
 
 		 1076 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  30.46 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  23.7 
 
 		 1257 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.82 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1036 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  26.72 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1299 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.79 
 
 		 1132 aa  60.8  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1338 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  32.33 
 
 		 1186 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  30.81 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1147 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  31.93 
 
 		 816 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  23.08 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  21.86 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  26.37 
 
 		 1159 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  28.04 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  37.36 
 
 		 1244 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1178 aa  54.7  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.94 
 
 		 389 aa  53.5  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  25.13 
 
 		 573 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1177 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1184 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  22.19 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  21.95 
 
 		 521 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  22.4 
 
 		 1239 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.56 
 
 		 289 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1282 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1209 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.77 
 
 		 527 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  36.71 
 
 		 1058 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  26.23 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  25.98 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  26.58 
 
 		 1222 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  31.09 
 
 		 792 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  28.65 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  34.15 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1243 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.36 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1366 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  29.41 
 
 		 1189 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1346 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  28.09 
 
 		 369 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  32.58 
 
 		 1252 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  23.58 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  30.22 
 
 		 262 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1233 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  27.53 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 882 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.92 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 1642 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  27.9 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  30 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  22.8 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.06 
 
 		 1020 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1195 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  35.44 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  29.49 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1173 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  29.17 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  29.93 
 
 		 1722 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  26.4 
 
 		 372 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  25.57 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1347 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  25.84 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  21.8 
 
 		 534 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  35.44 
 
 		 746 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  25.84 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1452 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  31.87 
 
 		 1256 aa  44.3  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.99 
 
 		 522 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  30.23 
 
 		 1669 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  25.57 
 
 		 481 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  26.52 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  26.26 
 
 		 369 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.91 
 
 		 1194 aa  43.1  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  25.68 
 
 		 2274 aa  43.1  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>