26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2327 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  85.22 
 
 		 372 aa  646    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  97.02 
 
 		 369 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  86.18 
 
 		 369 aa  634    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  96.48 
 
 		 382 aa  716    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  96.21 
 
 		 382 aa  714    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  85.37 
 
 		 369 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  86.18 
 
 		 369 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  85.64 
 
 		 369 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  95.12 
 
 		 369 aa  705    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  82.66 
 
 		 369 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  73.91 
 
 		 369 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  73.64 
 
 		 369 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  65.85 
 
 		 483 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  65.58 
 
 		 481 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  62.7 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0250  hypothetical protein  21.18 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5232  hypothetical protein  26.61 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774837  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  28.34 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  28.34 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  27.81 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  28.84 
 
 		 1113 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1118 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  28.04 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  28.78 
 
 		 1117 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.84 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>