26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0666 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  85.22 
 
 		 369 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  85.22 
 
 		 369 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  83.87 
 
 		 369 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  84.14 
 
 		 382 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  84.68 
 
 		 382 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  90.86 
 
 		 369 aa  678    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  91.67 
 
 		 369 aa  687    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  91.13 
 
 		 369 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  84.14 
 
 		 369 aa  643    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  80.11 
 
 		 369 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  74.39 
 
 		 369 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  74.39 
 
 		 369 aa  569  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  66.31 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  65.77 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  63.17 
 
 		 483 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  29.47 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  29.47 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  28.95 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5232  hypothetical protein  28.76 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774837  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  28.42 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0250  hypothetical protein  21.22 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  29.3 
 
 		 1113 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1118 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  26.73 
 
 		 1117 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  26.4 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>