59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4491 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  69.15 
 
 		 483 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  96.07 
 
 		 483 aa  907    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  100 
 
 		 481 aa  982    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  65.77 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  65.58 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  66.67 
 
 		 369 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  66.12 
 
 		 369 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  66.12 
 
 		 369 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  66.4 
 
 		 369 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  65.58 
 
 		 382 aa  477  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  65.58 
 
 		 369 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  66.4 
 
 		 369 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  64.23 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  65.04 
 
 		 369 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  62.6 
 
 		 369 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  62.33 
 
 		 369 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  62.22 
 
 		 101 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  61.11 
 
 		 101 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  100  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  52.63 
 
 		 101 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  54.44 
 
 		 98 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  44.21 
 
 		 110 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1017  hypothetical protein  51.11 
 
 		 100 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  47.92 
 
 		 105 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  47.96 
 
 		 113 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5232  hypothetical protein  26.16 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774837  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08169  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.23 
 
 		 106 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0250  hypothetical protein  21.39 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.96 
 
 		 91 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  30.27 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  30.27 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  30.27 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  46.74 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  30.41 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  28.63 
 
 		 1113 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.7 
 
 		 99 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523025  normal  0.092938 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4588  hypothetical protein  42.7 
 
 		 99 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4427  hypothetical protein  42.7 
 
 		 99 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4611  hypothetical protein  42.7 
 
 		 99 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.575955 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_34  hypothetical protein  36.54 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 1117 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  42.7 
 
 		 99 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2408  hypothetical protein  41.11 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661689  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1286  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2329  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000100909  hitchhiker  0.00000201991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.2 
 
 		 99 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1418  hypothetical protein  38.54 
 
 		 101 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1839  plasmid related protein  43.9 
 
 		 89 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0200  plasmid related protein  44.94 
 
 		 97 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0541  hypothetical protein  30.21 
 
 		 102 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1287  hypothetical protein  29.59 
 
 		 106 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1419  hypothetical protein  29.59 
 
 		 106 aa  50.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.42 
 
 		 730 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5284  plasmid related protein  34.04 
 
 		 92 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000508412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2328  hypothetical protein  27.55 
 
 		 106 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357298  hitchhiker  0.00000205859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2276  hypothetical protein  46.3 
 
 		 70 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.57 
 
 		 478 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>