56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1464 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  992    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  70.04 
 
 		 483 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  68.74 
 
 		 481 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  63.17 
 
 		 372 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  64.05 
 
 		 382 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  63.24 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  64.05 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  62.7 
 
 		 369 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  63.51 
 
 		 369 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  64.59 
 
 		 369 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  63.51 
 
 		 369 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  62.7 
 
 		 369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  62.43 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  62.43 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  61.35 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  61.35 
 
 		 369 aa  438  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  31.89 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  31.89 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  31.89 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0250  hypothetical protein  22.92 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  31.44 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  43.62 
 
 		 101 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  43.68 
 
 		 98 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  43.16 
 
 		 101 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  41.18 
 
 		 101 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  43.16 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.77 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1017  hypothetical protein  41.38 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  44.83 
 
 		 101 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1118 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.78 
 
 		 99 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523025  normal  0.092938 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4588  hypothetical protein  37.78 
 
 		 99 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5232  hypothetical protein  25.14 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774837  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_34  hypothetical protein  37.93 
 
 		 199 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2408  hypothetical protein  37.93 
 
 		 102 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661689  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  37.76 
 
 		 113 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4611  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.575955 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4427  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  29.47 
 
 		 1117 aa  67  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08169  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.71 
 
 		 106 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0200  plasmid related protein  41.24 
 
 		 97 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  27.4 
 
 		 1113 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.82 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  36.36 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1286  hypothetical protein  34.41 
 
 		 101 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2329  hypothetical protein  34.41 
 
 		 101 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000100909  hitchhiker  0.00000201991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1839  plasmid related protein  39.24 
 
 		 89 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5284  plasmid related protein  31.11 
 
 		 92 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000508412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0201  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0541  hypothetical protein  30.23 
 
 		 102 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  30.11 
 
 		 730 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  25.5 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>