25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0541 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0541  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1287  hypothetical protein  63.64 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2328  hypothetical protein  61.22 
 
 
106 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357298  hitchhiker  0.00000205859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1419  hypothetical protein  60.2 
 
 
106 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701172  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1418  hypothetical protein  37.21 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489471  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2329  hypothetical protein  39.53 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000100909  hitchhiker  0.00000201991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1286  hypothetical protein  39.53 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  33.7 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  32.22 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  32.22 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  32.65 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  35.38 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  29.89 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  29.21 
 
 
481 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.09 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  29.55 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  28.09 
 
 
483 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  30.23 
 
 
483 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.27 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0201  hypothetical protein  28.09 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_34  hypothetical protein  29.17 
 
 
199 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  30 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1017  hypothetical protein  29.21 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>