29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2329 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2329  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  209  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000100909  hitchhiker  0.00000201991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  209  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1418  hypothetical protein  87.13 
 
 		 101 aa  187  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  45.24 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  45.98 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  45.98 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  43.68 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0541  hypothetical protein  39.53 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  38.89 
 
 		 481 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  38.82 
 
 		 483 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  40.23 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1287  hypothetical protein  38.37 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2328  hypothetical protein  37.21 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357298  hitchhiker  0.00000205859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1419  hypothetical protein  37.21 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  34.41 
 
 		 483 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.78 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523025  normal  0.092938 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4588  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4427  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4611  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.575955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  32.56 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.91 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  35.63 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  37 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08169  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  32.26 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_34  hypothetical protein  29.55 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  33.65 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  27.91 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2408  hypothetical protein  32.95 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661689  normal  0.25029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>