34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3690 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  100 
 
 
99 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  67.68 
 
 
99 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  47.19 
 
 
101 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  46.07 
 
 
101 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  47.19 
 
 
101 aa  87  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  47.13 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  43.48 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2408  hypothetical protein  51.11 
 
 
102 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661689  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1017  hypothetical protein  45 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  39 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0201  hypothetical protein  43.02 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.18 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0200  plasmid related protein  48.91 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08169  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.56 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  44.94 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  43.75 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  42.86 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4611  hypothetical protein  42.05 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.575955 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4427  hypothetical protein  42.05 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4588  hypothetical protein  40.91 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527517  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.91 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523025  normal  0.092938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  38.2 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  39.53 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1839  plasmid related protein  44.32 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  31.82 
 
 
483 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_34  hypothetical protein  37.5 
 
 
199 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1286  hypothetical protein  27.91 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2329  hypothetical protein  27.91 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000100909  hitchhiker  0.00000201991 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5284  plasmid related protein  38.2 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000508412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1418  hypothetical protein  29.07 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489471  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0541  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1419  hypothetical protein  29.52 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701172  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1287  hypothetical protein  30.48 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2328  hypothetical protein  32.39 
 
 
106 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357298  hitchhiker  0.00000205859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>