28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1017 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1017  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  199  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2408  hypothetical protein  64.44 
 
 		 102 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661689  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  51.69 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  51.11 
 
 		 481 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  51.16 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08169  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  51.11 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_34  hypothetical protein  42.55 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1839  plasmid related protein  54.12 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  44.21 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  45.1 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  41.41 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  40.57 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  41.38 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  45.26 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  43.14 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  38 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.89 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4588  hypothetical protein  41.57 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.57 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523025  normal  0.092938 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4427  hypothetical protein  41.57 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4611  hypothetical protein  41.57 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.575955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0200  plasmid related protein  46.59 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  39.58 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0201  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5284  plasmid related protein  37.78 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000508412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0541  hypothetical protein  29.21 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>