29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1839 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1839  plasmid related protein  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1017  hypothetical protein  54.12 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2408  hypothetical protein  49.37 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661689  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.32 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  46.74 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  44.58 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  46.15 
 
 		 483 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0200  plasmid related protein  55 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  43.9 
 
 		 481 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08169  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.53 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  39.24 
 
 		 483 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  39.56 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0201  hypothetical protein  37.8 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4611  hypothetical protein  40.74 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.575955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  37.65 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.74 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523025  normal  0.092938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  40.74 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4588  hypothetical protein  40.74 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4427  hypothetical protein  40.74 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  39.51 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  41.03 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  38.27 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_34  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.52 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5284  plasmid related protein  37.8 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000508412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  38.55 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1286  hypothetical protein  31.25 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2329  hypothetical protein  31.25 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000100909  hitchhiker  0.00000201991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>