29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0201 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0201  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2730  plasmid related protein  53.01 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3690  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.02 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0200  plasmid related protein  41.76 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0973  hypothetical protein  36.59 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2408  hypothetical protein  40.91 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661689  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2697  hypothetical protein  37.8 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957436  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2367  hypothetical protein  34.15 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2838  hypothetical protein  39.33 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2221  hypothetical protein  34.15 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139341  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1017  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4520  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.94 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  33.33 
 
 
481 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1419  hypothetical protein  29.67 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701172  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  32.14 
 
 
483 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1839  plasmid related protein  37.8 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0785  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4427  hypothetical protein  36.51 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105743  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2328  hypothetical protein  28.09 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357298  hitchhiker  0.00000205859 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4611  hypothetical protein  36.51 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.575955 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0186  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1287  hypothetical protein  29.21 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4588  hypothetical protein  36.51 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527517  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.51 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523025  normal  0.092938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_252  hypothetical protein  33.67 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0196501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  30 
 
 
483 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1579  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0541  hypothetical protein  28.09 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08169  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.28 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>