26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5232 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5232  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  951    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  27.49 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  28.57 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  26.61 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  26.88 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  27.47 
 
 
382 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  26.61 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  28.92 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  26.58 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  28.14 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  26.3 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  28.76 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  28.53 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  27.81 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  21.95 
 
 
373 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  20.53 
 
 
373 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  26.42 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0250  hypothetical protein  21.43 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  20.23 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  25.14 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  22.07 
 
 
363 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  26.23 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  35.48 
 
 
756 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  33.33 
 
 
756 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
756 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  33.33 
 
 
757 aa  43.9  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>