26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0542 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  85.37 
 
 
369 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  86.18 
 
 
369 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  751    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  85.64 
 
 
382 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  86.18 
 
 
382 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  85.09 
 
 
369 aa  633  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  80.11 
 
 
372 aa  610  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  80.76 
 
 
369 aa  604  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  80.49 
 
 
369 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  80.49 
 
 
369 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  77.24 
 
 
369 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  73.37 
 
 
369 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  72.55 
 
 
369 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  65.04 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  64.77 
 
 
483 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  64.59 
 
 
483 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0250  hypothetical protein  23.63 
 
 
361 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5232  hypothetical protein  28.84 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774837  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  31.02 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  31.02 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  30.32 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  31.71 
 
 
1118 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  31.55 
 
 
1113 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  30.73 
 
 
1117 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  30.81 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.84 
 
 
478 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>