57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2164 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  59.86 
 
 		 1113 aa  1376    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  94.28 
 
 		 1117 aa  2173    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  100 
 
 		 1118 aa  2329    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1098 aa  105  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  23.13 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  22.85 
 
 		 1116 aa  98.6  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  23.49 
 
 		 757 aa  93.6  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  23.07 
 
 		 759 aa  93.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  23.07 
 
 		 759 aa  92.8  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  21.65 
 
 		 759 aa  92  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  24.03 
 
 		 749 aa  92.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  23.2 
 
 		 756 aa  92  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  23.2 
 
 		 756 aa  92  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  22.73 
 
 		 752 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  22.7 
 
 		 760 aa  90.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  23.94 
 
 		 749 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  23.23 
 
 		 759 aa  86.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  22.93 
 
 		 756 aa  85.9  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  22.78 
 
 		 861 aa  85.5  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  23.69 
 
 		 759 aa  85.1  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 		 788 aa  84.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  21.5 
 
 		 759 aa  84  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  31.71 
 
 		 369 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  22.61 
 
 		 768 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  26.65 
 
 		 562 aa  78.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  25.49 
 
 		 600 aa  77.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  28.11 
 
 		 369 aa  76.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  30.24 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  28.11 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  30.24 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  30.24 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  28.11 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  28.78 
 
 		 369 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  28.78 
 
 		 369 aa  74.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  29.86 
 
 		 382 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  28.91 
 
 		 382 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  30.41 
 
 		 369 aa  73.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  29.76 
 
 		 369 aa  73.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  30.92 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  30.41 
 
 		 369 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  27.19 
 
 		 372 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  27.91 
 
 		 363 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  27.43 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  27.43 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  26.22 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  26.01 
 
 		 802 aa  59.3  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 1246 aa  51.6  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  24.86 
 
 		 502 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0250  hypothetical protein  22.84 
 
 		 361 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  26.06 
 
 		 918 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  26.06 
 
 		 918 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  25.53 
 
 		 918 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  25.53 
 
 		 918 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  25.53 
 
 		 918 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  25.53 
 
 		 918 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  25.53 
 
 		 918 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 		 1152 aa  45.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>