85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1202 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  90.37 
 
 		 757 aa  1396    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  86.02 
 
 		 757 aa  1352    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  58.89 
 
 		 788 aa  819    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  71.27 
 
 		 749 aa  1070    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  86.66 
 
 		 756 aa  1339    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  96.97 
 
 		 759 aa  1500    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  100 
 
 		 768 aa  1587    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  97.1 
 
 		 759 aa  1502    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  96.71 
 
 		 759 aa  1492    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  88.95 
 
 		 760 aa  1390    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  79.61 
 
 		 759 aa  1246    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  89.96 
 
 		 756 aa  1387    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  69.52 
 
 		 752 aa  1033    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  89.7 
 
 		 756 aa  1384    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  71 
 
 		 749 aa  1068    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  80.39 
 
 		 759 aa  1256    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  95.52 
 
 		 759 aa  1484    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  96.46 
 
 		 600 aa  1167    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1098 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  27.12 
 
 		 1116 aa  210  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  26.44 
 
 		 861 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  30.25 
 
 		 562 aa  180  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  30.77 
 
 		 802 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  29.39 
 
 		 502 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  24.17 
 
 		 597 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1118 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  22.63 
 
 		 1117 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  24.58 
 
 		 1113 aa  67.8  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  23.42 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.55 
 
 		 918 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.55 
 
 		 914 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  22.09 
 
 		 467 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  24.87 
 
 		 872 aa  55.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  31.76 
 
 		 235 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  22.97 
 
 		 821 aa  55.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.02 
 
 		 777 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  20.32 
 
 		 1178 aa  53.9  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  24.14 
 
 		 901 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  28.86 
 
 		 918 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.88 
 
 		 1091 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  21.55 
 
 		 1120 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  21.91 
 
 		 980 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  21.15 
 
 		 1086 aa  52  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  22.37 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.47 
 
 		 1194 aa  51.2  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  22.85 
 
 		 773 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.54 
 
 		 1104 aa  51.2  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  28.19 
 
 		 918 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  23.1 
 
 		 1134 aa  50.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 991 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  22.42 
 
 		 1006 aa  50.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  22.85 
 
 		 663 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  24.15 
 
 		 892 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  24.5 
 
 		 899 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 918 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  24.21 
 
 		 988 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  22.28 
 
 		 1100 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  22.9 
 
 		 589 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 727 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  23.37 
 
 		 1086 aa  49.3  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  29.73 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  21.05 
 
 		 1120 aa  47.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  29.73 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  32.48 
 
 		 1904 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  29.73 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  29.73 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  29.73 
 
 		 918 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.73 
 
 		 918 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  21.64 
 
 		 458 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.95 
 
 		 1102 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  25.63 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  29.32 
 
 		 535 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  29.73 
 
 		 918 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 641 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  20.16 
 
 		 1113 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  20.16 
 
 		 1113 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 448 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1555  excinuclease ABC, B subunit  33.91 
 
 		 715 aa  45.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.862025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 447 aa  44.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  19.85 
 
 		 1222 aa  44.3  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  29.14 
 
 		 1122 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  26.12 
 
 		 1161 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  20.74 
 
 		 1067 aa  43.9  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  23.27 
 
 		 876 aa  44.3  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>