52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_C0012 on replicon NC_011655
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  98.72 
 
 
559 aa  1141    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  97.46 
 
 
562 aa  1096    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  37.56 
 
 
1116 aa  704    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  98.46 
 
 
597 aa  1200    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1042    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  100 
 
 
1098 aa  2293    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  92.63 
 
 
861 aa  1686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  82.7 
 
 
235 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  27.8 
 
 
757 aa  252  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  27.16 
 
 
756 aa  244  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  27.24 
 
 
759 aa  244  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 
756 aa  242  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  27.09 
 
 
752 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  27.11 
 
 
759 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  27.51 
 
 
760 aa  241  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  27.16 
 
 
756 aa  241  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  27.47 
 
 
757 aa  239  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  27.05 
 
 
759 aa  239  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  27.17 
 
 
759 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  26.94 
 
 
749 aa  238  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  27.47 
 
 
749 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  26.97 
 
 
768 aa  235  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 
759 aa  234  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
759 aa  232  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  26.18 
 
 
788 aa  208  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  31.15 
 
 
600 aa  194  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  28.54 
 
 
802 aa  152  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  23.15 
 
 
1118 aa  90.1  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  22.94 
 
 
1117 aa  87  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  21.7 
 
 
1113 aa  79.7  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0254  hypothetical protein  29.17 
 
 
165 aa  52  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0255  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  23.65 
 
 
918 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  23.77 
 
 
918 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  23.77 
 
 
918 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  23.53 
 
 
918 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  23.4 
 
 
918 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  23.53 
 
 
918 aa  49.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  23.53 
 
 
918 aa  49.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  23.53 
 
 
918 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  23.77 
 
 
918 aa  48.9  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  27.08 
 
 
1194 aa  47  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 
1765 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  22.33 
 
 
918 aa  46.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  31.46 
 
 
821 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  29.81 
 
 
1178 aa  45.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21820  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.19 
 
 
690 aa  45.8  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  32.95 
 
 
773 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  32.63 
 
 
663 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  22.91 
 
 
918 aa  45.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  24.85 
 
 
1134 aa  44.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  31.33 
 
 
672 aa  44.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>