120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  85.28 
 
 		 752 aa  1301    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  71.27 
 
 		 768 aa  1070    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  71.27 
 
 		 759 aa  1071    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  100 
 
 		 749 aa  1543    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  68.52 
 
 		 757 aa  1043    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  60.73 
 
 		 788 aa  841    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  71 
 
 		 759 aa  1069    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  71 
 
 		 759 aa  1068    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  70.83 
 
 		 756 aa  1066    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  70.87 
 
 		 757 aa  1067    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  67.52 
 
 		 759 aa  1030    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  98.26 
 
 		 749 aa  1518    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  71.58 
 
 		 759 aa  1079    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  72.77 
 
 		 600 aa  866    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  70.56 
 
 		 756 aa  1063    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  70.69 
 
 		 756 aa  1069    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  70.09 
 
 		 760 aa  1061    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  67.93 
 
 		 759 aa  1038    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1098 aa  238  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  27.27 
 
 		 1116 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  31.62 
 
 		 562 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  26.04 
 
 		 861 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  28.47 
 
 		 802 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  31.3 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1118 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  23.02 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 918 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  26.82 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  26.82 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  26.82 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  26.82 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  25.93 
 
 		 918 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  26.82 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  23.23 
 
 		 1113 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  26.82 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  26.33 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  25.2 
 
 		 918 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  23.78 
 
 		 1117 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 		 918 aa  62  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  23.08 
 
 		 980 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  22.9 
 
 		 1194 aa  59.7  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  22.92 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  25.76 
 
 		 958 aa  57.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  25.13 
 
 		 991 aa  56.2  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  23.02 
 
 		 1108 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  22.45 
 
 		 589 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  24.94 
 
 		 901 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  22.93 
 
 		 777 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 1102 aa  55.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  22.13 
 
 		 1093 aa  54.7  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  23.77 
 
 		 1006 aa  53.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  21.32 
 
 		 1178 aa  53.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  21.52 
 
 		 1086 aa  53.5  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.22 
 
 		 918 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  25.19 
 
 		 1078 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  39.2 
 
 		 848 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  23.48 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  32.53 
 
 		 235 aa  52.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  23.8 
 
 		 1072 aa  52  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  23.68 
 
 		 1134 aa  51.6  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  25.53 
 
 		 1055 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  21.96 
 
 		 914 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.14 
 
 		 1091 aa  51.6  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 		 892 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  24.57 
 
 		 1019 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 1028 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  25.56 
 
 		 899 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  21.73 
 
 		 821 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 		 1261 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  24.5 
 
 		 1531 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.93 
 
 		 1113 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  21.93 
 
 		 1113 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.25 
 
 		 1155 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  19.66 
 
 		 467 aa  49.3  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  42.19 
 
 		 1084 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  22.06 
 
 		 1080 aa  48.5  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.91 
 
 		 741 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  21.95 
 
 		 1150 aa  48.5  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  40.62 
 
 		 1084 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  22.1 
 
 		 1131 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  34.26 
 
 		 988 aa  47.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  21.68 
 
 		 648 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  20.83 
 
 		 458 aa  47.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  20.63 
 
 		 1088 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  24.05 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  23.48 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  19.74 
 
 		 572 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  21.62 
 
 		 964 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.61 
 
 		 988 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  23.48 
 
 		 663 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.07 
 
 		 1087 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  43.75 
 
 		 1084 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  23.71 
 
 		 621 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.78 
 
 		 966 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  23.46 
 
 		 990 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  23.24 
 
 		 1007 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  31.63 
 
 		 1901 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  21.88 
 
 		 1904 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  23.79 
 
 		 902 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  24.08 
 
 		 917 aa  45.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>