More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1415 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  100 
 
 
458 aa  940    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  53.86 
 
 
454 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  52.07 
 
 
457 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  51.09 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  51.09 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  49.02 
 
 
453 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  49.45 
 
 
453 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  49.23 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  49.23 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  48.02 
 
 
448 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  46.68 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  40.96 
 
 
472 aa  336  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  40.74 
 
 
472 aa  336  5e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  40.31 
 
 
472 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  40.31 
 
 
472 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  40.09 
 
 
472 aa  333  5e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  37.15 
 
 
463 aa  316  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  40.95 
 
 
470 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  32.3 
 
 
477 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  36.71 
 
 
295 aa  177  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1173  hypothetical protein  46.89 
 
 
189 aa  163  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00228603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  25.96 
 
 
452 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  25.97 
 
 
493 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  27.78 
 
 
674 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  25.81 
 
 
918 aa  99.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  25.81 
 
 
918 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  26.45 
 
 
918 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  25.59 
 
 
918 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  25.59 
 
 
918 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  25.59 
 
 
918 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  25.59 
 
 
918 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  25.59 
 
 
918 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
918 aa  97.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 
918 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  25.81 
 
 
918 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.62 
 
 
1102 aa  94  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.15 
 
 
1110 aa  93.6  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  27.17 
 
 
1284 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  24.89 
 
 
1163 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  24.49 
 
 
572 aa  90.5  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 
1066 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  27.75 
 
 
574 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
1118 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  24.26 
 
 
985 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  25.17 
 
 
1068 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1739  SNF2-related protein  26.44 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  25.5 
 
 
1354 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  24.15 
 
 
1181 aa  84.3  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.06 
 
 
933 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  26 
 
 
925 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
1068 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  25.34 
 
 
1127 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  25.32 
 
 
809 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  26.02 
 
 
1006 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  26.15 
 
 
924 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  25.4 
 
 
1086 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 
1403 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  23.97 
 
 
1449 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
1069 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 
1082 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  24.53 
 
 
1250 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  24.32 
 
 
1096 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  25.45 
 
 
1357 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  25 
 
 
1141 aa  81.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  25.11 
 
 
872 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  25.51 
 
 
1073 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  26.75 
 
 
1084 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  23.89 
 
 
1025 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  24.94 
 
 
1021 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  22.71 
 
 
1227 aa  80.1  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.04 
 
 
907 aa  79.7  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  24.94 
 
 
1072 aa  80.1  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  25.6 
 
 
1064 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.27 
 
 
1082 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  24.67 
 
 
964 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  25.18 
 
 
1064 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  25.06 
 
 
1082 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  24.58 
 
 
1068 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  26.36 
 
 
1130 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  25.46 
 
 
1031 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  23.11 
 
 
1032 aa  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 
1152 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  24.61 
 
 
1082 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  24.94 
 
 
1064 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  24.94 
 
 
1064 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  24.94 
 
 
1064 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  24.94 
 
 
1064 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  25.71 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  23.28 
 
 
1175 aa  77  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  24.94 
 
 
1064 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  25.34 
 
 
1070 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  23.86 
 
 
1064 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  24.82 
 
 
1159 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  24.03 
 
 
633 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.27 
 
 
1091 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  24.61 
 
 
1082 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  24.22 
 
 
1437 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
1069 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  25.06 
 
 
1154 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  21.9 
 
 
1002 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>