78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1463 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  69.21 
 
 		 756 aa  1035    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  69.75 
 
 		 756 aa  1040    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  70.48 
 
 		 759 aa  1057    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  70.07 
 
 		 759 aa  1051    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  69.7 
 
 		 760 aa  1043    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  67.43 
 
 		 759 aa  1029    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  60.29 
 
 		 788 aa  837    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  68.89 
 
 		 757 aa  1047    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  69.99 
 
 		 757 aa  1041    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  85.28 
 
 		 749 aa  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  69.84 
 
 		 756 aa  1051    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  86.82 
 
 		 749 aa  1323    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  70.2 
 
 		 759 aa  1052    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  70.07 
 
 		 759 aa  1052    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  69.52 
 
 		 768 aa  1046    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  100 
 
 		 752 aa  1550    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  67.16 
 
 		 759 aa  1023    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  72.9 
 
 		 600 aa  867    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1098 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  26.6 
 
 		 1116 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  25.95 
 
 		 861 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  30.1 
 
 		 562 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  31.07 
 
 		 802 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  29.07 
 
 		 502 aa  141  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  24.67 
 
 		 597 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1118 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  22.44 
 
 		 1113 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  22.88 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  24.38 
 
 		 1117 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  24.68 
 
 		 918 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  24.68 
 
 		 918 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  24.48 
 
 		 918 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.68 
 
 		 918 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.68 
 
 		 918 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  24.22 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.68 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.68 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  23.31 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  24.68 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  22.17 
 
 		 1093 aa  62.4  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  24.86 
 
 		 918 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  23.08 
 
 		 589 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  25.06 
 
 		 901 aa  54.3  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  22.05 
 
 		 980 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  39.06 
 
 		 1084 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  24.81 
 
 		 291 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  40.62 
 
 		 1084 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  30.12 
 
 		 235 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  21.37 
 
 		 1194 aa  49.7  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  32.1 
 
 		 832 aa  49.3  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  24.75 
 
 		 958 aa  48.5  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  34.43 
 
 		 1087 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  38.03 
 
 		 1150 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  20.15 
 
 		 467 aa  48.5  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 848 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  21.12 
 
 		 1222 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  22.61 
 
 		 956 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  22.54 
 
 		 995 aa  47.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 		 633 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 		 1261 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 1118 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  20.98 
 
 		 821 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 641 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 		 1155 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 892 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  32.53 
 
 		 1209 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  40.62 
 
 		 1084 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  23.87 
 
 		 899 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.36 
 
 		 741 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  21.58 
 
 		 937 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  21.43 
 
 		 648 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.38 
 
 		 777 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  39.13 
 
 		 1184 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  22.22 
 
 		 821 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  37.5 
 
 		 991 aa  43.9  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.87 
 
 		 917 aa  43.9  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  19.79 
 
 		 1178 aa  43.9  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  32.22 
 
 		 1612 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>