More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0896 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  100 
 
 		 917 aa  1865    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  37.9 
 
 		 746 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.8 
 
 		 741 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  36.61 
 
 		 885 aa  322  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  36.71 
 
 		 727 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  35.39 
 
 		 1122 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  30.75 
 
 		 1284 aa  193  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  33.04 
 
 		 1084 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  27.79 
 
 		 985 aa  188  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  32.6 
 
 		 1084 aa  187  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  29.33 
 
 		 1250 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 1112 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  28.98 
 
 		 1181 aa  179  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 1112 aa  179  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  29.03 
 
 		 1112 aa  178  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  27.48 
 
 		 1065 aa  177  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1449 aa  177  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  29.48 
 
 		 1175 aa  176  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  28.51 
 
 		 1072 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  28.24 
 
 		 918 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  28.24 
 
 		 918 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  28.24 
 
 		 918 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  28.24 
 
 		 918 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  28.24 
 
 		 918 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  26.57 
 
 		 918 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 1048 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  26.57 
 
 		 918 aa  174  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.38 
 
 		 1067 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 918 aa  173  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  28.6 
 
 		 1386 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  29.18 
 
 		 891 aa  173  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  27.09 
 
 		 918 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  27.41 
 
 		 1063 aa  172  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  27.79 
 
 		 902 aa  172  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 1055 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 1139 aa  171  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  28.91 
 
 		 1025 aa  170  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 		 1068 aa  170  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  28.09 
 
 		 1032 aa  170  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  29.23 
 
 		 1437 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.45 
 
 		 1034 aa  170  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.01 
 
 		 1031 aa  170  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  27.71 
 
 		 1047 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  26.7 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.96 
 
 		 988 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.06 
 
 		 977 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.69 
 
 		 1381 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 1047 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.17 
 
 		 1078 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.66 
 
 		 1362 aa  168  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  30.33 
 
 		 1080 aa  168  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.42 
 
 		 1069 aa  168  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  29.85 
 
 		 1069 aa  168  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  28.51 
 
 		 901 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  28.41 
 
 		 1130 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  28.44 
 
 		 1068 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 633 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  26.99 
 
 		 959 aa  167  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  28.09 
 
 		 964 aa  167  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 1069 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  28.85 
 
 		 1431 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  29.17 
 
 		 1084 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1088 aa  165  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1088 aa  165  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 1403 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  27.77 
 
 		 1071 aa  166  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 1091 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.97 
 
 		 1099 aa  165  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 918 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  26.44 
 
 		 1163 aa  164  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.35 
 
 		 1354 aa  164  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  28.09 
 
 		 1125 aa  163  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  30.35 
 
 		 1082 aa  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  27.65 
 
 		 1006 aa  161  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 1021 aa  160  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.47 
 
 		 1110 aa  160  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.26 
 
 		 907 aa  160  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 		 641 aa  160  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 1118 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 982 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  27.43 
 
 		 1096 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 1171 aa  159  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 892 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  25.21 
 
 		 1019 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  30.02 
 
 		 1088 aa  158  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  30.13 
 
 		 1082 aa  158  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 1002 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  26.8 
 
 		 1077 aa  158  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  27.03 
 
 		 1003 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.41 
 
 		 1068 aa  157  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  28.1 
 
 		 1159 aa  157  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 		 1261 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.71 
 
 		 1082 aa  156  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 1152 aa  156  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 		 1104 aa  156  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  26.16 
 
 		 899 aa  156  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  27.04 
 
 		 1154 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  27.12 
 
 		 896 aa  155  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  29.91 
 
 		 1082 aa  155  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.16 
 
 		 1227 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>