More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1035 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.64 
 
 		 1089 aa  285  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  49.66 
 
 		 1082 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  49.14 
 
 		 1102 aa  279  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  45.89 
 
 		 1087 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.84 
 
 		 1112 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  44.89 
 
 		 1125 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  41.67 
 
 		 1394 aa  258  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 		 1082 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 		 1139 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  44.48 
 
 		 1357 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  45.91 
 
 		 1068 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.52 
 
 		 1068 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  41.44 
 
 		 1077 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  45.99 
 
 		 1069 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  43.43 
 
 		 1071 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  44.33 
 
 		 1386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  42.57 
 
 		 1084 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  45.62 
 
 		 1069 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  43.99 
 
 		 1362 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.1 
 
 		 1069 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  42.23 
 
 		 1084 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  43.79 
 
 		 1031 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  44.67 
 
 		 1069 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  43.06 
 
 		 1068 aa  238  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.16 
 
 		 1403 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 		 1091 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 		 1021 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.77 
 
 		 1113 aa  231  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  43.77 
 
 		 1113 aa  231  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  43.64 
 
 		 1084 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.78 
 
 		 907 aa  229  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  40.55 
 
 		 1055 aa  228  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.05 
 
 		 773 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.4 
 
 		 663 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  38.97 
 
 		 1354 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  40.88 
 
 		 1209 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  40.34 
 
 		 1381 aa  225  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  40.8 
 
 		 1181 aa  224  1e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.07 
 
 		 914 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.07 
 
 		 918 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  42.8 
 
 		 1064 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  43.96 
 
 		 1088 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 		 1129 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 		 1108 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  42.42 
 
 		 1064 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.88 
 
 		 1178 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  40.54 
 
 		 1437 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  41.1 
 
 		 1003 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 982 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.92 
 
 		 1088 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.39 
 
 		 1150 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  43.77 
 
 		 1070 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 		 1090 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  38.57 
 
 		 1250 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.58 
 
 		 1088 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  41.3 
 
 		 1100 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.72 
 
 		 977 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 		 1449 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.21 
 
 		 1110 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  43.73 
 
 		 1134 aa  215  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.14 
 
 		 1104 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  38.62 
 
 		 1154 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.37 
 
 		 1086 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 		 1261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.58 
 
 		 1091 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.52 
 
 		 1171 aa  213  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  39.43 
 
 		 1142 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 		 1160 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 		 1066 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  40.91 
 
 		 1064 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  40.75 
 
 		 1064 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.03 
 
 		 1155 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  40.91 
 
 		 1064 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  40.91 
 
 		 1064 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  40.91 
 
 		 1064 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  40.91 
 
 		 1064 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 		 1068 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  41.24 
 
 		 1127 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  39.86 
 
 		 1130 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 		 1118 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  40.58 
 
 		 959 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 		 1066 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  39.8 
 
 		 666 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  40.53 
 
 		 1064 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.34 
 
 		 1105 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  40.79 
 
 		 777 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 		 1105 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  37.5 
 
 		 1161 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.21 
 
 		 1062 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  40.29 
 
 		 1141 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  38.14 
 
 		 964 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  37.46 
 
 		 1284 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  37.59 
 
 		 1025 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  39.17 
 
 		 1110 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.21 
 
 		 1143 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  37.12 
 
 		 1080 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  41.49 
 
 		 1086 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  43.11 
 
 		 1082 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  39.38 
 
 		 1164 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>