89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0667 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  89.87 
 
 		 759 aa  1402    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  88.95 
 
 		 768 aa  1390    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  90.13 
 
 		 759 aa  1405    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  81.45 
 
 		 759 aa  1276    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  80.66 
 
 		 759 aa  1268    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  100 
 
 		 760 aa  1566    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  70.09 
 
 		 749 aa  1061    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  85.11 
 
 		 757 aa  1337    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  69.7 
 
 		 752 aa  1031    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  59.8 
 
 		 788 aa  829    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  89.74 
 
 		 759 aa  1401    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  92.22 
 
 		 756 aa  1424    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  92.62 
 
 		 757 aa  1431    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  87.6 
 
 		 756 aa  1357    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  70.09 
 
 		 749 aa  1061    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  89.47 
 
 		 759 aa  1401    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  90.24 
 
 		 600 aa  1100    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  91.82 
 
 		 756 aa  1419    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1098 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  27.81 
 
 		 1116 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  31.09 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  26.57 
 
 		 861 aa  180  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  27.99 
 
 		 802 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  30.29 
 
 		 502 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  21.7 
 
 		 1113 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1118 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  24.37 
 
 		 597 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 1117 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  23.18 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  23.19 
 
 		 970 aa  61.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  23.22 
 
 		 821 aa  61.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  23.44 
 
 		 1178 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  21.27 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.41 
 
 		 918 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  22.77 
 
 		 1100 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  21.82 
 
 		 1086 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.41 
 
 		 914 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.77 
 
 		 777 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  31.76 
 
 		 235 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.22 
 
 		 1091 aa  54.3  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  24.51 
 
 		 901 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  23.06 
 
 		 872 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  25.39 
 
 		 991 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  22.08 
 
 		 554 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  21.61 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.51 
 
 		 1104 aa  52  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  22.6 
 
 		 1134 aa  51.6  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.66 
 
 		 1194 aa  50.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  21.1 
 
 		 509 aa  50.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  23.88 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  28.19 
 
 		 918 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  21.18 
 
 		 1904 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  23.17 
 
 		 1086 aa  48.9  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 727 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  29.73 
 
 		 1161 aa  48.5  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  26.21 
 
 		 1045 aa  48.5  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  24.2 
 
 		 899 aa  48.5  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  27.52 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  20.36 
 
 		 1222 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  21.58 
 
 		 980 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 1102 aa  47.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  24.81 
 
 		 701 aa  47.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  28.57 
 
 		 535 aa  47.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  21.57 
 
 		 1108 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  25 
 
 		 1093 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  21.65 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  21.43 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  21.65 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  21.65 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  21.65 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  21.88 
 
 		 1120 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  28.06 
 
 		 1084 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  21.83 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  22.81 
 
 		 1209 aa  45.8  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  28.06 
 
 		 1084 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  22.22 
 
 		 896 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  20.91 
 
 		 1901 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  23.83 
 
 		 1025 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  28.4 
 
 		 1769 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 448 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  25 
 
 		 898 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  27.78 
 
 		 1064 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 447 aa  44.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  21.16 
 
 		 1006 aa  44.3  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  28.17 
 
 		 452 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 1068 aa  44.3  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 641 aa  44.3  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 1002 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  21.56 
 
 		 1120 aa  44.3  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>