More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00510 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  54.64 
 
 
701 aa  728    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  100 
 
 
1045 aa  2172    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  41.83 
 
 
1086 aa  415  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  41.83 
 
 
806 aa  412  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  43.39 
 
 
707 aa  408  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  46.51 
 
 
849 aa  350  7e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  31.13 
 
 
972 aa  305  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  28.03 
 
 
1198 aa  290  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  28.05 
 
 
1202 aa  277  7e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  30.77 
 
 
1127 aa  275  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 
842 aa  247  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  27.83 
 
 
900 aa  226  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  33.1 
 
 
1184 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.15 
 
 
1170 aa  208  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  25.1 
 
 
1359 aa  204  9e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
1110 aa  201  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  32.11 
 
 
1132 aa  187  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  30.95 
 
 
715 aa  177  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  31 
 
 
1277 aa  174  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  24.55 
 
 
1901 aa  168  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  26.8 
 
 
1107 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  25.86 
 
 
939 aa  161  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  25.04 
 
 
868 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  25.12 
 
 
1848 aa  156  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  25.44 
 
 
609 aa  155  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  25 
 
 
1769 aa  152  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  43.89 
 
 
1142 aa  145  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  26.02 
 
 
1093 aa  145  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  48.37 
 
 
1159 aa  143  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  30.61 
 
 
1354 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  28.6 
 
 
509 aa  142  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  45.09 
 
 
1164 aa  141  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  45.66 
 
 
985 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  45.93 
 
 
1154 aa  140  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  24.45 
 
 
1904 aa  138  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.51 
 
 
1160 aa  137  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  45.45 
 
 
1386 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  44.89 
 
 
1362 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 
1068 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  41.28 
 
 
1120 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  43.71 
 
 
1250 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.69 
 
 
1102 aa  135  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  42.2 
 
 
959 aa  134  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  43.78 
 
 
1125 aa  134  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  41.28 
 
 
1120 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  42.44 
 
 
1112 aa  134  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.05 
 
 
1110 aa  132  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.98 
 
 
1129 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  42.44 
 
 
1055 aa  131  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
1021 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  26.5 
 
 
1161 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  46.2 
 
 
1100 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  46.05 
 
 
1437 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  25.89 
 
 
1068 aa  129  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.07 
 
 
1102 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
1118 aa  128  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  43.35 
 
 
1130 aa  128  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.77 
 
 
1091 aa  127  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
1164 aa  127  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  45.71 
 
 
988 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.77 
 
 
1155 aa  127  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  28.49 
 
 
1178 aa  127  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  41.67 
 
 
1062 aa  126  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  30.33 
 
 
1031 aa  126  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  43.71 
 
 
977 aa  126  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  39.88 
 
 
1096 aa  126  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  43.02 
 
 
1357 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  47.2 
 
 
1134 aa  126  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.05 
 
 
964 aa  126  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  42.01 
 
 
1127 aa  126  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1090 aa  125  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
1261 aa  125  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  41.86 
 
 
1081 aa  125  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 
1029 aa  125  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  27.99 
 
 
621 aa  124  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  43.42 
 
 
1066 aa  124  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  27.93 
 
 
777 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  43.95 
 
 
1284 aa  124  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  27.5 
 
 
1070 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.02 
 
 
1143 aa  124  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 
1108 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  43.6 
 
 
1150 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  27.97 
 
 
1025 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  28.9 
 
 
918 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  40.35 
 
 
1163 aa  122  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  41.21 
 
 
1084 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  45.39 
 
 
1381 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
1082 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  41.21 
 
 
1084 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
982 aa  122  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 
1047 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  46.43 
 
 
1086 aa  122  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  43.35 
 
 
1088 aa  122  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 
1403 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.98 
 
 
1087 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.9 
 
 
914 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  28.36 
 
 
1047 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  42.31 
 
 
1086 aa  121  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  41.83 
 
 
1069 aa  121  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
1171 aa  121  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>