More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1653 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  100 
 
 		 452 aa  937    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.02 
 
 		 977 aa  163  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  29.56 
 
 		 1003 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.8 
 
 		 1068 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 		 982 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 1091 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 1155 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  29.54 
 
 		 1150 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  27.17 
 
 		 1068 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  28.27 
 
 		 1071 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 		 1069 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 1002 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  27.92 
 
 		 1181 aa  146  9e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 1068 aa  146  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  29.41 
 
 		 1091 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  27.59 
 
 		 1113 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 1113 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 		 559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 1261 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  30.31 
 
 		 1082 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  30.61 
 
 		 1082 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  30.09 
 
 		 1082 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 		 1171 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 		 1403 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.2 
 
 		 1102 aa  139  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.25 
 
 		 1055 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 1068 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  29.52 
 
 		 1073 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  25.96 
 
 		 809 aa  137  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 876 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.99 
 
 		 1110 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  30.09 
 
 		 1070 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 		 1139 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  29.29 
 
 		 1070 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  28.97 
 
 		 1031 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.22 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  25.91 
 
 		 1284 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 1073 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.28 
 
 		 914 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  28.82 
 
 		 1084 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 		 1104 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  27.88 
 
 		 448 aa  133  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 1073 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  27.4 
 
 		 1127 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  27.97 
 
 		 1086 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.88 
 
 		 918 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 		 950 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  28.44 
 
 		 896 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  30.14 
 
 		 1209 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 1108 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  28.13 
 
 		 1088 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  25.51 
 
 		 1025 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  29.2 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  27.74 
 
 		 1100 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  26.92 
 
 		 1084 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  25.89 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  28.89 
 
 		 1134 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 1073 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  27.6 
 
 		 1084 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.01 
 
 		 1082 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  25.59 
 
 		 988 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 		 1129 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  28.97 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 1073 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  26.71 
 
 		 1354 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  26.04 
 
 		 872 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  28.05 
 
 		 872 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  26.85 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  26.71 
 
 		 995 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 1021 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  25.74 
 
 		 956 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  27.65 
 
 		 1062 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  29.82 
 
 		 1112 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  24.23 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  28.83 
 
 		 773 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 1066 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.17 
 
 		 907 aa  124  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 848 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  26.55 
 
 		 991 aa  124  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  26.39 
 
 		 1202 aa  123  6e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  26.46 
 
 		 1069 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  25.9 
 
 		 1072 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  27.11 
 
 		 959 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  26.68 
 
 		 1069 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  27.81 
 
 		 964 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  27.56 
 
 		 1125 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  25.79 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 1066 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 		 1120 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  24.4 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1105 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  27.19 
 
 		 1437 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 1068 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 1105 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.17 
 
 		 1026 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  28.31 
 
 		 666 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  26.59 
 
 		 1130 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  25.39 
 
 		 1386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 		 906 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  26.58 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>