97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0540 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  86.81 
 
 		 759 aa  1353    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  78 
 
 		 759 aa  1219    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  68.89 
 
 		 752 aa  1030    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  86.02 
 
 		 768 aa  1343    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  86.54 
 
 		 759 aa  1350    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  68.52 
 
 		 749 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  100 
 
 		 757 aa  1555    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  58.09 
 
 		 788 aa  813    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  86.68 
 
 		 759 aa  1352    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  85.11 
 
 		 760 aa  1329    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  83.86 
 
 		 756 aa  1299    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  84.28 
 
 		 757 aa  1306    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  68.52 
 
 		 749 aa  1040    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  85.73 
 
 		 759 aa  1340    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  85.52 
 
 		 600 aa  1049    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  77.47 
 
 		 759 aa  1221    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  83.99 
 
 		 756 aa  1298    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  83.33 
 
 		 756 aa  1291    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1098 aa  259  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  27.5 
 
 		 1116 aa  218  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  27.76 
 
 		 861 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  32.09 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  31.27 
 
 		 502 aa  154  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  29.37 
 
 		 802 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1118 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  24.94 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  25.37 
 
 		 1113 aa  85.1  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  23.59 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 1117 aa  65.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  32.94 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  20.84 
 
 		 1178 aa  55.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  22.84 
 
 		 872 aa  55.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  22.33 
 
 		 1100 aa  54.7  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  20 
 
 		 1016 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  21.35 
 
 		 1086 aa  54.3  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  20.76 
 
 		 1093 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  22.05 
 
 		 970 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  21.76 
 
 		 554 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.19 
 
 		 918 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  23.5 
 
 		 980 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  21.75 
 
 		 821 aa  51.6  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  21.63 
 
 		 914 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  24.87 
 
 		 991 aa  50.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  24.52 
 
 		 899 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  20.83 
 
 		 1108 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.03 
 
 		 1194 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  23.65 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  24.53 
 
 		 777 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  22.25 
 
 		 560 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  23.9 
 
 		 901 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.99 
 
 		 1104 aa  49.3  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  21.9 
 
 		 1134 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  22.48 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.48 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  21.89 
 
 		 663 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  21.97 
 
 		 555 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.54 
 
 		 1102 aa  48.5  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  23.88 
 
 		 1025 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 		 892 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  24.79 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  21.19 
 
 		 560 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  21.19 
 
 		 560 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  21.19 
 
 		 560 aa  47.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  21.19 
 
 		 560 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  21.19 
 
 		 560 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  24.79 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  26.39 
 
 		 917 aa  47.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  21.19 
 
 		 560 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  22.84 
 
 		 560 aa  47.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  31.62 
 
 		 1904 aa  47.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  21.26 
 
 		 560 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 727 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  22.94 
 
 		 988 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  27.82 
 
 		 535 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  21.9 
 
 		 560 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  23.99 
 
 		 1086 aa  46.6  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  20.15 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.4 
 
 		 1091 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  22.42 
 
 		 1006 aa  46.6  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  21.99 
 
 		 959 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  24.52 
 
 		 918 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.52 
 
 		 918 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.52 
 
 		 918 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  23.77 
 
 		 958 aa  45.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 		 1002 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  24.52 
 
 		 918 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  23.11 
 
 		 1193 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.52 
 
 		 918 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  24.55 
 
 		 949 aa  45.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.52 
 
 		 918 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  22.14 
 
 		 1181 aa  45.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  24.52 
 
 		 918 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 		 898 aa  44.3  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  23.38 
 
 		 876 aa  44.3  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  20.74 
 
 		 458 aa  44.3  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  23.02 
 
 		 902 aa  44.3  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  20.61 
 
 		 1066 aa  43.9  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>