130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1646 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  67.16 
 
 		 752 aa  1011    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  96.31 
 
 		 759 aa  1495    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  80.39 
 
 		 768 aa  1256    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  80.39 
 
 		 759 aa  1259    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  67.52 
 
 		 749 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  78 
 
 		 757 aa  1232    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  58.36 
 
 		 788 aa  811    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  80.26 
 
 		 759 aa  1257    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  80.92 
 
 		 759 aa  1263    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  80.74 
 
 		 756 aa  1254    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  81.29 
 
 		 757 aa  1264    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  67.25 
 
 		 749 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  81.79 
 
 		 756 aa  1271    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  80.53 
 
 		 759 aa  1261    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  81.48 
 
 		 600 aa  1001    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  81.45 
 
 		 760 aa  1276    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  100 
 
 		 759 aa  1567    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  81.13 
 
 		 756 aa  1261    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1098 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  27.97 
 
 		 1116 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  32.09 
 
 		 562 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  26.12 
 
 		 861 aa  180  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  26.36 
 
 		 802 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  29.63 
 
 		 502 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1118 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  23.66 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.54 
 
 		 1091 aa  70.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  23.74 
 
 		 1113 aa  70.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  25.09 
 
 		 559 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  21.15 
 
 		 1117 aa  64.3  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  23.31 
 
 		 918 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  20.73 
 
 		 1178 aa  63.9  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.48 
 
 		 777 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.31 
 
 		 914 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  24.27 
 
 		 1086 aa  60.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  23.27 
 
 		 1100 aa  59.3  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  25.57 
 
 		 991 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  20.78 
 
 		 1108 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.96 
 
 		 1104 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  22.11 
 
 		 970 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  21.79 
 
 		 467 aa  54.7  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  31.76 
 
 		 235 aa  54.3  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  24.42 
 
 		 985 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  21.88 
 
 		 872 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  20.42 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  20.42 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  25.2 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  23.92 
 
 		 918 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  22.84 
 
 		 1134 aa  52  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  25.2 
 
 		 1084 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  22.7 
 
 		 821 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1088 aa  51.6  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  22.34 
 
 		 1209 aa  51.6  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  27.4 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  28.89 
 
 		 1161 aa  50.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  23.64 
 
 		 589 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 		 1118 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  23.66 
 
 		 918 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 1102 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  27.51 
 
 		 1194 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  26.21 
 
 		 1045 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  23.81 
 
 		 1086 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  21.07 
 
 		 663 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  21.17 
 
 		 773 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  21.21 
 
 		 1082 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  21.21 
 
 		 1082 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  24.26 
 
 		 901 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  22.62 
 
 		 918 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.94 
 
 		 1403 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  20.45 
 
 		 1080 aa  48.9  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  21.25 
 
 		 458 aa  48.5  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  22.53 
 
 		 896 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 641 aa  48.5  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  29.32 
 
 		 535 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.06 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  24.06 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.06 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  24.06 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  21.38 
 
 		 509 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  32.48 
 
 		 1904 aa  47.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  20.71 
 
 		 663 aa  48.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  24.06 
 
 		 918 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.11 
 
 		 1181 aa  47  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.06 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  21.39 
 
 		 1150 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  22.37 
 
 		 959 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  20.94 
 
 		 1082 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.99 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  22.5 
 
 		 860 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  22.35 
 
 		 1120 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.06 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  20.66 
 
 		 1070 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  20.88 
 
 		 1386 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  23.36 
 
 		 1064 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.21 
 
 		 988 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  20.61 
 
 		 1070 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  23.31 
 
 		 701 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  21.27 
 
 		 876 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 		 918 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>