53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0268 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  94.28 
 
 		 1118 aa  2157    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1117 aa  2329    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  60.39 
 
 		 1113 aa  1384    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  22.41 
 
 		 1116 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1098 aa  98.2  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  23.2 
 
 		 757 aa  95.5  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  22.79 
 
 		 757 aa  86.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  22.5 
 
 		 756 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  22.41 
 
 		 756 aa  84.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  23 
 
 		 861 aa  84  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  22.82 
 
 		 749 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 788 aa  81.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  26.34 
 
 		 600 aa  80.9  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  22.94 
 
 		 749 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  21.73 
 
 		 759 aa  79.7  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  22.64 
 
 		 768 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0542  hypothetical protein  30.73 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  24.38 
 
 		 752 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  22.83 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  26.41 
 
 		 562 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  22.44 
 
 		 756 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  25.12 
 
 		 760 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  25.24 
 
 		 759 aa  75.5  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  26.34 
 
 		 759 aa  75.1  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  25.48 
 
 		 759 aa  74.3  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  27.65 
 
 		 369 aa  73.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  27.65 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  27.65 
 
 		 369 aa  72  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  23.9 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  28.29 
 
 		 369 aa  71.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1647  hypothetical protein  29.95 
 
 		 369 aa  70.1  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3404  hypothetical protein  29.27 
 
 		 369 aa  70.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4491  O-methyl transferase family protein  29.27 
 
 		 481 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  29.27 
 
 		 483 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1203  hypothetical protein  27.8 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1288  hypothetical protein  28.91 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2327  hypothetical protein  28.78 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457837  hitchhiker  0.0000027329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1420  hypothetical protein  27.96 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0873411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0458  hypothetical protein  29.95 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0666  hypothetical protein  26.73 
 
 		 372 aa  67  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1464  hypothetical protein  29.47 
 
 		 483 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0014  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0017  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.339807 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0015  hypothetical protein  26.64 
 
 		 363 aa  58.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0121  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  24.05 
 
 		 802 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 1246 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  28.45 
 
 		 918 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  28.45 
 
 		 918 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 1152 aa  46.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  24.11 
 
 		 1354 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  22.16 
 
 		 597 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  28.26 
 
 		 544 aa  44.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>