107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2368 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  69.99 
 
 		 752 aa  1028    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  90.37 
 
 		 768 aa  1396    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  91.69 
 
 		 759 aa  1415    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  70.87 
 
 		 749 aa  1067    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  84.28 
 
 		 757 aa  1314    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  59.85 
 
 		 788 aa  825    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  91.16 
 
 		 759 aa  1411    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  91.29 
 
 		 759 aa  1410    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  98.81 
 
 		 756 aa  1529    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  100 
 
 		 757 aa  1558    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  70.87 
 
 		 749 aa  1071    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  90.89 
 
 		 759 aa  1402    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  91.6 
 
 		 600 aa  1111    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  98.15 
 
 		 756 aa  1528    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  90.07 
 
 		 756 aa  1389    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  92.62 
 
 		 760 aa  1432    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  80.37 
 
 		 759 aa  1256    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  81.29 
 
 		 759 aa  1265    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1098 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  29 
 
 		 1116 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  27.18 
 
 		 861 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  30.75 
 
 		 562 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  31.24 
 
 		 802 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  29.89 
 
 		 502 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1118 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  24.69 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  22.75 
 
 		 1117 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  24.69 
 
 		 1113 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  23.8 
 
 		 559 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.97 
 
 		 918 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.59 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  23.2 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  21.93 
 
 		 1086 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  21.96 
 
 		 970 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  23.44 
 
 		 1178 aa  58.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  22.77 
 
 		 1100 aa  58.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  25.06 
 
 		 991 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.4 
 
 		 777 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  23.1 
 
 		 1134 aa  55.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  24.25 
 
 		 872 aa  55.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  31.76 
 
 		 235 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.51 
 
 		 1104 aa  55.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.16 
 
 		 1091 aa  54.7  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  24.57 
 
 		 901 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  20.59 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  28.15 
 
 		 1161 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  21.84 
 
 		 980 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  23.43 
 
 		 1086 aa  51.6  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.39 
 
 		 1194 aa  51.6  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  20.9 
 
 		 1120 aa  51.2  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 1102 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  20.61 
 
 		 1222 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  30.08 
 
 		 535 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  24.4 
 
 		 918 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  26.03 
 
 		 1093 aa  50.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  21.85 
 
 		 1108 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  26.21 
 
 		 1045 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  22.04 
 
 		 663 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  24.81 
 
 		 701 aa  48.5  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  26.71 
 
 		 589 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.46 
 
 		 918 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 727 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  23.1 
 
 		 985 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.15 
 
 		 1084 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  25.62 
 
 		 898 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  21.87 
 
 		 1120 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.15 
 
 		 1084 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  27.03 
 
 		 939 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  31.62 
 
 		 1904 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1088 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  22.3 
 
 		 458 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  21.69 
 
 		 1080 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  22.93 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  20.69 
 
 		 1113 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  20.69 
 
 		 1113 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  22.42 
 
 		 896 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  22.93 
 
 		 663 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  28.21 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 641 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  20.63 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  21.32 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  21.66 
 
 		 1006 aa  45.8  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  22.88 
 
 		 1209 aa  45.8  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.26 
 
 		 1181 aa  45.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  28.12 
 
 		 1159 aa  45.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  23.47 
 
 		 1025 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  23.82 
 
 		 899 aa  45.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  22.76 
 
 		 495 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  21.2 
 
 		 1901 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 		 1002 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  22.33 
 
 		 1150 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  28.57 
 
 		 1769 aa  44.3  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  22.17 
 
 		 1105 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 447 aa  44.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  22.34 
 
 		 1354 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  25.38 
 
 		 746 aa  44.3  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  30.08 
 
 		 918 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 		 918 aa  44.3  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>