More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0415 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  100 
 
 		 727 aa  1467    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  53.85 
 
 		 746 aa  687    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  48.69 
 
 		 741 aa  558  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  44.94 
 
 		 1122 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  45.32 
 
 		 885 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.71 
 
 		 917 aa  321  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 641 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.57 
 
 		 1034 aa  177  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 1112 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  33.26 
 
 		 1354 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 892 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  31.96 
 
 		 1064 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  31.96 
 
 		 1064 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  31.13 
 
 		 901 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.11 
 
 		 1386 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  31.59 
 
 		 1064 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  26.32 
 
 		 1125 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  29.73 
 
 		 1084 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  31.59 
 
 		 1064 aa  165  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  31.59 
 
 		 1064 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  31.59 
 
 		 1064 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  31.59 
 
 		 1064 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.01 
 
 		 1031 aa  164  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  30.79 
 
 		 1066 aa  163  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  28.73 
 
 		 1084 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  31.5 
 
 		 1362 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  31.36 
 
 		 1064 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  31.14 
 
 		 1064 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 		 1139 aa  161  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  31.81 
 
 		 1068 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  28.73 
 
 		 1130 aa  160  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  28.29 
 
 		 1084 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  27.42 
 
 		 1194 aa  160  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  27.89 
 
 		 1069 aa  160  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 898 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  30.8 
 
 		 949 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  24.42 
 
 		 1152 aa  158  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 1089 aa  158  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  28.35 
 
 		 917 aa  158  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 1029 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.19 
 
 		 777 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.97 
 
 		 1102 aa  157  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.32 
 
 		 1134 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  27.48 
 
 		 1069 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.22 
 
 		 1082 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 876 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  27.27 
 
 		 891 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  30.92 
 
 		 1120 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  29.98 
 
 		 899 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  28.1 
 
 		 918 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  29.76 
 
 		 1065 aa  154  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  30.92 
 
 		 1120 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 1055 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  29.16 
 
 		 1164 aa  154  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 933 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  27.88 
 
 		 1070 aa  153  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 1120 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.32 
 
 		 914 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  26.65 
 
 		 1087 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  27.29 
 
 		 1181 aa  152  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 		 559 aa  152  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 1403 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  27.56 
 
 		 1032 aa  152  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  30.19 
 
 		 1381 aa  152  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  25.81 
 
 		 1071 aa  151  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  33.03 
 
 		 985 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  29.11 
 
 		 1178 aa  150  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  28.21 
 
 		 1082 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 925 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.41 
 
 		 1067 aa  150  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  28.28 
 
 		 1082 aa  150  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  26.73 
 
 		 1250 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.34 
 
 		 988 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.59 
 
 		 1068 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 1164 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  26.56 
 
 		 959 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.04 
 
 		 1099 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  28.82 
 
 		 924 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  27.93 
 
 		 1088 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 		 895 aa  147  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  28.42 
 
 		 1082 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 1091 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  27.62 
 
 		 964 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 1021 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.11 
 
 		 907 aa  147  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  29.74 
 
 		 1112 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.44 
 
 		 1069 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 918 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  28.49 
 
 		 1142 aa  147  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  27.4 
 
 		 1080 aa  147  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  27.91 
 
 		 1070 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  30.57 
 
 		 991 aa  147  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 1129 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  25.88 
 
 		 918 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  30.09 
 
 		 1209 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  25.88 
 
 		 918 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  27.86 
 
 		 1284 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 1108 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  27.21 
 
 		 1068 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>