More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4600 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  100 
 
 		 746 aa  1489    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  53.71 
 
 		 727 aa  680    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  48.68 
 
 		 741 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  49.85 
 
 		 885 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  48.6 
 
 		 1122 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.5 
 
 		 917 aa  353  8.999999999999999e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.58 
 
 		 959 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  30.34 
 
 		 1250 aa  187  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  34.73 
 
 		 1354 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.63 
 
 		 1034 aa  183  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  33.56 
 
 		 1209 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 1112 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  30.09 
 
 		 1084 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  30.09 
 
 		 1084 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 		 641 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  31.61 
 
 		 1284 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  27.78 
 
 		 1181 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.25 
 
 		 1134 aa  173  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  33.41 
 
 		 633 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  31.43 
 
 		 901 aa  171  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  33.19 
 
 		 988 aa  170  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 1139 aa  170  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 		 1403 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  26.67 
 
 		 891 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 933 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  31.79 
 
 		 1065 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.61 
 
 		 1078 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  30.15 
 
 		 1072 aa  167  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  30.65 
 
 		 1006 aa  167  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  30.44 
 
 		 924 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  31.05 
 
 		 1112 aa  166  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  31.63 
 
 		 1362 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.88 
 
 		 1082 aa  165  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.44 
 
 		 925 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  29.72 
 
 		 1069 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.85 
 
 		 1386 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  28.73 
 
 		 964 aa  164  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  31.99 
 
 		 1120 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  27.49 
 
 		 1125 aa  163  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  27.53 
 
 		 1032 aa  163  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.72 
 
 		 1069 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.22 
 
 		 1031 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  30.84 
 
 		 1086 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  32.45 
 
 		 1381 aa  163  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 898 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  31.77 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  29.74 
 
 		 902 aa  162  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  32.39 
 
 		 1025 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  28.96 
 
 		 1070 aa  161  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.96 
 
 		 1099 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  29.85 
 
 		 1048 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  30 
 
 		 1130 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  31.6 
 
 		 1159 aa  160  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  27.52 
 
 		 1071 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 		 1152 aa  159  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.48 
 
 		 1194 aa  159  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 1089 aa  159  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  32.08 
 
 		 1019 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 1069 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 1002 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  30.13 
 
 		 980 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 		 1007 aa  158  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  31.63 
 
 		 1063 aa  158  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  29.41 
 
 		 1077 aa  158  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.19 
 
 		 1067 aa  158  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.89 
 
 		 1112 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 1021 aa  157  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  27.34 
 
 		 1193 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.8 
 
 		 1084 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  28.89 
 
 		 1087 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  31.31 
 
 		 1062 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 1055 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  29.03 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.32 
 
 		 777 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 892 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  28.38 
 
 		 1068 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  30.37 
 
 		 1007 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  32.49 
 
 		 985 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  28.39 
 
 		 1023 aa  155  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  27.77 
 
 		 1080 aa  154  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  28.7 
 
 		 1082 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 		 1120 aa  154  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 1164 aa  154  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 1091 aa  153  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  28.35 
 
 		 1088 aa  153  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 		 1449 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 1066 aa  153  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  28.51 
 
 		 1068 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  30.71 
 
 		 1019 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  31.69 
 
 		 1040 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  31.52 
 
 		 886 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  28.11 
 
 		 1175 aa  151  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  28.48 
 
 		 1082 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  31.35 
 
 		 899 aa  151  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  29.61 
 
 		 1073 aa  151  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  30.66 
 
 		 1064 aa  151  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  29.25 
 
 		 1047 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  30.87 
 
 		 1121 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 918 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  29.46 
 
 		 917 aa  150  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>