More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2778 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 405 aa  798    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  23.67 
 
 		 595 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  24.77 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  22.93 
 
 		 578 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  22.93 
 
 		 578 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  23.2 
 
 		 573 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  21.16 
 
 		 604 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  22.03 
 
 		 584 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  23.43 
 
 		 527 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  28.86 
 
 		 523 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  22.5 
 
 		 488 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  26.83 
 
 		 673 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  21.38 
 
 		 495 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  21.04 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  21.78 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  21.97 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  22 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.39 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  28.57 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  21.67 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  20 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.34 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  23.11 
 
 		 822 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  29.58 
 
 		 730 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  21.24 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  30.46 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  21.9 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  23.37 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  23.59 
 
 		 908 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  20.36 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  24.81 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  26.09 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.92 
 
 		 974 aa  63.2  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  24.19 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  23.4 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  21.05 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  30.23 
 
 		 519 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  22.64 
 
 		 587 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.45 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  32.2 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  22.89 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  24.42 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  26.03 
 
 		 518 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  26.03 
 
 		 518 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  26.09 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  22.67 
 
 		 816 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  23.86 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  23.2 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  25.13 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  26.4 
 
 		 908 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  23.74 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  23.47 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  23.74 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  23.18 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  26.59 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  20.87 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  21.43 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  22.37 
 
 		 808 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  22.19 
 
 		 834 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  24.68 
 
 		 508 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  22.41 
 
 		 824 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.03 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  25.55 
 
 		 517 aa  57  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 708 aa  56.6  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.71 
 
 		 1002 aa  56.6  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  30.23 
 
 		 1089 aa  56.6  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  30.09 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  23.64 
 
 		 846 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  26.17 
 
 		 1343 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  28.91 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  23.43 
 
 		 873 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  28.91 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  24.75 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  23.02 
 
 		 814 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  21.89 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  25.53 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  24.03 
 
 		 513 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  27.65 
 
 		 1693 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  27.86 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  25.53 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 540 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.59 
 
 		 587 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  22.81 
 
 		 534 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  26.37 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  26.81 
 
 		 794 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 707 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  24.45 
 
 		 515 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  27.97 
 
 		 829 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  26.43 
 
 		 793 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  24.19 
 
 		 528 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>