30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3090 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  100 
 
 		 527 aa  1100    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  57.55 
 
 		 504 aa  591  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  57.2 
 
 		 488 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  57.69 
 
 		 497 aa  558  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  43.21 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  42.42 
 
 		 495 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  38.77 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  26.62 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.31 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  27.33 
 
 		 604 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 		 405 aa  97.8  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  24.18 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  24.18 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  26.38 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  26.73 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  23.89 
 
 		 563 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  21.02 
 
 		 584 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.89 
 
 		 522 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  22.69 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  23 
 
 		 488 aa  47  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  23.94 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  24.15 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  23 
 
 		 488 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  23.2 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  22.16 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  21.59 
 
 		 521 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  23.83 
 
 		 489 aa  44.3  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  22.16 
 
 		 489 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  23.83 
 
 		 489 aa  44.3  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  22.68 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>