114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0217 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  99.83 
 
 		 578 aa  1183    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 578 aa  1185    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  39.66 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  34.84 
 
 		 595 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  35.95 
 
 		 573 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  32.88 
 
 		 563 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  34.63 
 
 		 604 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  22.93 
 
 		 405 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  28.23 
 
 		 504 aa  90.9  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  26.08 
 
 		 488 aa  90.5  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  28.66 
 
 		 495 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.81 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  26.61 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  24.18 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  25.84 
 
 		 499 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.67 
 
 		 950 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2939  N-6 DNA methylase  24.33 
 
 		 926 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  29.11 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  24.32 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  21.55 
 
 		 911 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.57 
 
 		 974 aa  60.1  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1125 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1270 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  27.32 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  20.42 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  20.08 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  28.38 
 
 		 908 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1093 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  27.4 
 
 		 489 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  27.4 
 
 		 489 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  22.45 
 
 		 524 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.73 
 
 		 654 aa  55.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  25.21 
 
 		 768 aa  54.3  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  25.65 
 
 		 528 aa  53.9  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  22.68 
 
 		 509 aa  53.9  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  27.37 
 
 		 481 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.32 
 
 		 684 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  24.88 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  17.97 
 
 		 1058 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1022 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.21 
 
 		 1134 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  26.16 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 493 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  24.41 
 
 		 493 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 746 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.4 
 
 		 673 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1129 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 508 aa  50.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.05 
 
 		 416 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  29.76 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1497 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.33 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  27.03 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.01 
 
 		 1194 aa  48.5  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  25.83 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.97 
 
 		 995 aa  48.9  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  29.13 
 
 		 527 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  22.73 
 
 		 389 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.8 
 
 		 466 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 		 513 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  25.89 
 
 		 554 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.17 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  24.31 
 
 		 489 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  25.96 
 
 		 554 aa  47.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1174 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  27.49 
 
 		 489 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 570 aa  47.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1231 aa  47  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  27.6 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  26.72 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  26.56 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  22.6 
 
 		 1038 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 		 504 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  22.28 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  30.51 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  24.36 
 
 		 480 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  27.01 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  24.53 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  22.63 
 
 		 503 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1324 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  24.43 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.04 
 
 		 1170 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.24 
 
 		 502 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1338 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1177 aa  45.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  31.96 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  23 
 
 		 826 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.5 
 
 		 522 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 		 673 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0636  N-6 DNA methylase  32.65 
 
 		 545 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  23.75 
 
 		 967 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  25.26 
 
 		 410 aa  44.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>