More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0324 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 657 aa  1364    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.52 
 
 		 654 aa  610  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  37.98 
 
 		 684 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  30.17 
 
 		 687 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  28.52 
 
 		 748 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  28.97 
 
 		 796 aa  219  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_002950  PG0544  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.48 
 
 		 648 aa  218  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  26.59 
 
 		 738 aa  209  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  27.54 
 
 		 676 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.56 
 
 		 730 aa  146  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  25.66 
 
 		 605 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  28.36 
 
 		 707 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 768 aa  123  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  30.38 
 
 		 866 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 911 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 		 499 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  25.64 
 
 		 553 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  29.93 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.17 
 
 		 489 aa  107  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  27.07 
 
 		 513 aa  107  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  29.21 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  29.93 
 
 		 834 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  29.58 
 
 		 509 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  25.07 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 544 aa  104  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 544 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 554 aa  103  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  29.93 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  28.33 
 
 		 846 aa  103  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  30.06 
 
 		 549 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.24 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  25.72 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.82 
 
 		 498 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 		 496 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  26.95 
 
 		 480 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  26.25 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 775 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 506 aa  99.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 		 498 aa  97.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  26.49 
 
 		 545 aa  97.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.76 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  26.7 
 
 		 477 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 513 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 495 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  27.91 
 
 		 492 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.48 
 
 		 502 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  29.2 
 
 		 481 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 		 818 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  27.72 
 
 		 500 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.02 
 
 		 1134 aa  95.1  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  26.64 
 
 		 506 aa  94.4  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  23.01 
 
 		 579 aa  94  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  29.27 
 
 		 493 aa  93.6  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  27.74 
 
 		 484 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5290  N-6 DNA methylase  31.74 
 
 		 668 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 		 485 aa  92.8  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  28.83 
 
 		 481 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  26.16 
 
 		 481 aa  92.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 		 489 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  24.14 
 
 		 486 aa  90.9  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  27.21 
 
 		 534 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 517 aa  90.5  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  24.56 
 
 		 484 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  25.91 
 
 		 492 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  26.74 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.28 
 
 		 703 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 571 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  27.03 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 481 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1145  N-6 DNA methylase  27.72 
 
 		 628 aa  88.6  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  24.92 
 
 		 527 aa  88.2  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.13 
 
 		 533 aa  88.2  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  24.49 
 
 		 814 aa  87.8  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  26.6 
 
 		 514 aa  87  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.08 
 
 		 504 aa  87  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  25.69 
 
 		 539 aa  87  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 		 710 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  27.99 
 
 		 501 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  25.27 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  28.62 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.94 
 
 		 808 aa  86.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.94 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25.68 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  25.91 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  27.27 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.28 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  23.44 
 
 		 1343 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  27.04 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  28.42 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  26.67 
 
 		 489 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 516 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.82 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  25.25 
 
 		 822 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 1005 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>