More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1092 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 505 aa  1049    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  56.51 
 
 		 499 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  46.72 
 
 		 579 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  50.57 
 
 		 554 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  48.36 
 
 		 553 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  48 
 
 		 553 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  47 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  48.18 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  48.44 
 
 		 508 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  46.72 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  49.8 
 
 		 493 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.31 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  45.59 
 
 		 517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  45.76 
 
 		 527 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  45.83 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  42.88 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  42.7 
 
 		 544 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  45.38 
 
 		 489 aa  445  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  46.46 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  42.7 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  44.26 
 
 		 545 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  42.96 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  43.31 
 
 		 512 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  40.46 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  43.55 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.63 
 
 		 548 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  38.86 
 
 		 524 aa  389  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  46.3 
 
 		 563 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  56.04 
 
 		 1005 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  36.51 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  39 
 
 		 818 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  34.55 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  33.74 
 
 		 846 aa  240  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  33.54 
 
 		 834 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  28.49 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  29.12 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  31.76 
 
 		 775 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  30.23 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  29.15 
 
 		 495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  27.49 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  29.67 
 
 		 490 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.63 
 
 		 484 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  28.27 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 493 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  28.6 
 
 		 484 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  27.48 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.02 
 
 		 484 aa  186  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  27.29 
 
 		 493 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  28.6 
 
 		 488 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  28.68 
 
 		 489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  26.93 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  26.81 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  28.35 
 
 		 489 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  28.35 
 
 		 489 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  27.97 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  27.51 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  28.03 
 
 		 489 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  28.81 
 
 		 488 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  26.91 
 
 		 509 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  26.49 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25.8 
 
 		 479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 		 490 aa  174  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.09 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  26.95 
 
 		 710 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 484 aa  170  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  27.05 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  27.2 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  26.88 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  27 
 
 		 489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  31.13 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  26.39 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  27.35 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.27 
 
 		 489 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 485 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  29.09 
 
 		 481 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  31.13 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.83 
 
 		 530 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 		 484 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  28.8 
 
 		 534 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.6 
 
 		 703 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  29.77 
 
 		 479 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  24.91 
 
 		 519 aa  153  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  30.56 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  30.19 
 
 		 539 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  29.28 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.15 
 
 		 523 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  29.15 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  28.26 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  29.29 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  28.67 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  29.29 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 571 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.94 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  31.37 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  31.37 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  29.98 
 
 		 494 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>