More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5277 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  100 
 
 
571 aa  1179    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  61.96 
 
 
534 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  46.47 
 
 
509 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  42.19 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  39.06 
 
 
494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  35.75 
 
 
519 aa  279  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  38.11 
 
 
710 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  33.33 
 
 
486 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  37.62 
 
 
490 aa  256  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  37.35 
 
 
484 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  37.1 
 
 
484 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.36 
 
 
703 aa  250  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  35.58 
 
 
486 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  31.71 
 
 
493 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  36.62 
 
 
481 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.24 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  35.15 
 
 
503 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  29.95 
 
 
492 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.49 
 
 
484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  32.12 
 
 
488 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  31.05 
 
 
501 aa  233  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  31.63 
 
 
500 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  31.36 
 
 
488 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  32.04 
 
 
489 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  33.48 
 
 
489 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  30.7 
 
 
493 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  31.49 
 
 
500 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  32.84 
 
 
490 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  31.7 
 
 
493 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  32.67 
 
 
495 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  32.92 
 
 
484 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  33.02 
 
 
489 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  33.02 
 
 
489 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  31.62 
 
 
489 aa  219  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  34.91 
 
 
481 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 
484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  33.03 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  31.71 
 
 
479 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  31.02 
 
 
481 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  34.21 
 
 
489 aa  213  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  29.98 
 
 
484 aa  210  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.58 
 
 
502 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  32.52 
 
 
489 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  32.02 
 
 
489 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  31.18 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  31.36 
 
 
489 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 
549 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.74 
 
 
484 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  28.64 
 
 
484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 
499 aa  160  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 
529 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 
570 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  29.34 
 
 
481 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  27.58 
 
 
493 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  26.75 
 
 
529 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  27.89 
 
 
554 aa  157  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  26.75 
 
 
529 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  28.67 
 
 
479 aa  157  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.51 
 
 
529 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  27.65 
 
 
539 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  27.38 
 
 
553 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  29.4 
 
 
537 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  33.09 
 
 
553 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.41 
 
 
530 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.92 
 
 
533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  28.78 
 
 
484 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  27.84 
 
 
540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  33.7 
 
 
513 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.94 
 
 
504 aa  147  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.86 
 
 
529 aa  147  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  28.05 
 
 
517 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  32.27 
 
 
579 aa  146  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  28.97 
 
 
506 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  28.5 
 
 
494 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  28.28 
 
 
563 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  30.45 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  34.78 
 
 
516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  30.17 
 
 
512 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  32.05 
 
 
478 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.87 
 
 
548 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  27.29 
 
 
514 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 
489 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  35.66 
 
 
846 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  27.59 
 
 
506 aa  139  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  25.64 
 
 
544 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 
544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  25.96 
 
 
530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 
544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  35.52 
 
 
481 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  34.06 
 
 
524 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  26.58 
 
 
513 aa  137  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  33.95 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  28.1 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.2 
 
 
508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  33.85 
 
 
775 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  34.63 
 
 
834 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  34.43 
 
 
429 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  34.43 
 
 
429 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>