More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4881 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  66.46 
 
 		 489 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  82.17 
 
 		 493 aa  849    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  63.37 
 
 		 493 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  65.3 
 
 		 489 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  100 
 
 		 489 aa  1019    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  66.46 
 
 		 489 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  67.08 
 
 		 489 aa  681    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  62.96 
 
 		 489 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  62.96 
 
 		 489 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  91 
 
 		 493 aa  937    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  67.28 
 
 		 489 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  79.88 
 
 		 501 aa  843    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  81.78 
 
 		 500 aa  840    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  62.22 
 
 		 485 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  81.01 
 
 		 500 aa  823    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  63.88 
 
 		 492 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  63.75 
 
 		 490 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  60.57 
 
 		 479 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  59.38 
 
 		 484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  57.87 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  61.99 
 
 		 481 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  57.82 
 
 		 481 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  57.61 
 
 		 481 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  59.14 
 
 		 488 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  52.6 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  49.5 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  50.51 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  49.9 
 
 		 489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  48.03 
 
 		 519 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  44.49 
 
 		 710 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.11 
 
 		 703 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  36.25 
 
 		 484 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  35.83 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  35.63 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  36.64 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  36.44 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  33.79 
 
 		 494 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  34.65 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.22 
 
 		 484 aa  277  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  33.33 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  34.95 
 
 		 534 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  35.67 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  33.47 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  33.86 
 
 		 495 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  34.76 
 
 		 490 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41600  DNA methylase  56.52 
 
 		 212 aa  238  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  32.04 
 
 		 571 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  28.87 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  28.88 
 
 		 499 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  33.64 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  33.26 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  30.12 
 
 		 505 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  30.6 
 
 		 489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  29.35 
 
 		 508 aa  183  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  27.37 
 
 		 506 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.01 
 
 		 530 aa  181  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  29.08 
 
 		 544 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  30.02 
 
 		 553 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.84 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  29.79 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  31.99 
 
 		 539 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  29.08 
 
 		 549 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  29.76 
 
 		 480 aa  176  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  26.76 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  29.36 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  27.95 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  30.63 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  27.74 
 
 		 544 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  31.36 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  31.01 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  30.39 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  29.31 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  27.98 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  30.93 
 
 		 481 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  29.95 
 
 		 563 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  32.34 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  27.73 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  29.3 
 
 		 579 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  27.07 
 
 		 570 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 493 aa  162  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.05 
 
 		 504 aa  162  9e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  34.21 
 
 		 1005 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  31.32 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.73 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.31 
 
 		 533 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  27.4 
 
 		 516 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  31.11 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  29.96 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  30.04 
 
 		 495 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 		 495 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.49 
 
 		 529 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  30.8 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  32.01 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.79 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  31.4 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.8 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>