More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1201 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  67.41 
 
 		 486 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  71.89 
 
 		 498 aa  745    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 499 aa  1045    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  70.73 
 
 		 495 aa  749    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  68.83 
 
 		 495 aa  743    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  71.75 
 
 		 495 aa  754    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  53.05 
 
 		 494 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  53.9 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  53.9 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  44.88 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  43.76 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  43.29 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  44.73 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  43.37 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  43.51 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  43.94 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  43.17 
 
 		 479 aa  363  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  41.11 
 
 		 489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  40.07 
 
 		 530 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  40.11 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.04 
 
 		 533 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  43.18 
 
 		 486 aa  346  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  38.66 
 
 		 537 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  40.28 
 
 		 514 aa  341  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  40.94 
 
 		 529 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  40.94 
 
 		 529 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  39.81 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  40 
 
 		 529 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.74 
 
 		 529 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.46 
 
 		 530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 		 490 aa  174  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  30.27 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  31.32 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  28.94 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  29.15 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  29.39 
 
 		 570 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  32.54 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  30.9 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  32.25 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  27.23 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  30.56 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  32.15 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  29.59 
 
 		 554 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  30.43 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  30.32 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  29.04 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  29.05 
 
 		 479 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  30.17 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  30.12 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  30.82 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  30.43 
 
 		 500 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.64 
 
 		 484 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  26.9 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  30.31 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  32.02 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.09 
 
 		 703 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  29.77 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  29.72 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 544 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  28.7 
 
 		 506 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.5 
 
 		 508 aa  143  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  28.77 
 
 		 545 aa  143  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  28.6 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  28.38 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  28.77 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  31.18 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  27.84 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  28.11 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  29.91 
 
 		 488 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 544 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.99 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  26.9 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  28.37 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.7 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  29.83 
 
 		 481 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  30.14 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.03 
 
 		 502 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  28.08 
 
 		 489 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  30.95 
 
 		 512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  28.88 
 
 		 534 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  27.91 
 
 		 517 aa  136  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  27.25 
 
 		 549 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  30 
 
 		 481 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  29.82 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  27.88 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  28.29 
 
 		 484 aa  135  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  29.47 
 
 		 824 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  26.65 
 
 		 509 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  30.72 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  27.54 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  28.41 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  30 
 
 		 489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.85 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  28.61 
 
 		 540 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>